84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1758 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1758  transport protein  100 
 
 		 432 aa  856    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1749  transport protein  65.75 
 
 		 435 aa  549  1e-155  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.439809  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2039  transport protein  59.47 
 
 		 455 aa  507  9.999999999999999e-143  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1865  citrate transporter  58.94 
 
 		 455 aa  470  1.0000000000000001e-131  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0006  Na+/H+ antiporter family protein  53.23 
 
 		 433 aa  440  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0435713  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0006  Na+/H+ antiporter family protein  53 
 
 		 433 aa  440  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000950539  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2204  Na+/H+ antiporter family protein  52.76 
 
 		 433 aa  427  1e-118  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000124721  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0032  Na+/H+ antiporter family protein  53.46 
 
 		 433 aa  424  1e-117  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.540321  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0558  Na+/H+ antiporter family protein  47.02 
 
 		 446 aa  398  9.999999999999999e-111  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000048202 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0477  Na+/H+ antiporter NhaC  52.07 
 
 		 434 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1540  Na+/H+ antiporter family protein  49.11 
 
 		 450 aa  386  1e-106  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0526  hypothetical protein  49.55 
 
 		 441 aa  381  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4127  hypothetical protein  47.06 
 
 		 439 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00423015 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4213  hypothetical protein  46.83 
 
 		 439 aa  375  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3845  Na+/H+ antiporter  47.29 
 
 		 439 aa  378  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3859  Na+/H+ antiporter  47.06 
 
 		 439 aa  375  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4325  hypothetical protein  46.83 
 
 		 439 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.895738  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1024  hypothetical protein  46.61 
 
 		 439 aa  375  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4236  hypothetical protein  46.61 
 
 		 439 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4172  hypothetical protein  46.83 
 
 		 439 aa  374  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02993  hypothetical protein  47.7 
 
 		 431 aa  375  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4012  hypothetical protein  46.83 
 
 		 439 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2802  Na+ antiporter NhaC  46.83 
 
 		 439 aa  374  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.936373  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0887  Na+/H+ antiporter NhaC  48.87 
 
 		 446 aa  372  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.801907  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1014  permease  46.74 
 
 		 452 aa  375  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.747204  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3935  Na+/H+ antiporter NhaC  46.15 
 
 		 439 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.10264  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1861  sodium/proton antiporter  46.83 
 
 		 442 aa  369  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2575  Na+/H+ antiporter NhaC  45.27 
 
 		 439 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000723865  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002937  hypothetical protein  48.13 
 
 		 425 aa  365  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000304263  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1515  Na+/H+ antiporter NhaC  45.27 
 
 		 439 aa  363  3e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000563518  normal  0.487296 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2095  hypothetical protein  45.29 
 
 		 440 aa  361  1e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.425927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2742  Na+/H+ antiporter NhaC  46.03 
 
 		 439 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000444326  hitchhiker  0.000511547 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2092  Na+/H+ antiporter NhaC  45.5 
 
 		 445 aa  354  1e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000144395  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2449  Na+/H+ antiporter NhaC  45.95 
 
 		 439 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00774297  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2377  Na+/H+ antiporter NhaC  45.72 
 
 		 439 aa  353  4e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00605411  normal  0.730196 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1847  Na+/H+ antiporter NhaC  46.29 
 
 		 439 aa  353  5e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000629445  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2757  hypothetical protein  45.95 
 
 		 439 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2542  Na+/H+ antiporter NhaC  45.27 
 
 		 439 aa  351  1e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000174807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2547  Na+/H+ antiporter NhaC  45.05 
 
 		 439 aa  346  6e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000475833  hitchhiker  0.0000000305197 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1776  Na+/H+ antiporter NhaC  45.05 
 
 		 439 aa  346  6e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000109905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1737  Na+/H+ antiporter NhaC  45.05 
 
 		 439 aa  346  6e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000126474  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1733  Na+/H+ antiporter NhaC  45.05 
 
 		 439 aa  346  6e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000745905  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1454  Na+/H+ antiporter NhaC  45.54 
 
 		 442 aa  345  8e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0056  Na+/H+ antiporter NhaC  42.66 
 
 		 440 aa  342  7e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.455554  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1598  Na+/H+ antiporter NhaC  44.59 
 
 		 439 aa  336  5e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000151079  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0529  hypothetical protein  42.63 
 
 		 438 aa  334  2e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0114104  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0943  Na+/H+ antiporter NhaC  41.27 
 
 		 438 aa  333  4e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000851242  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0962  Na+ antiporter NhaC  41.27 
 
 		 438 aa  333  4e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000234758  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1651  Na+/H+ antiporter NhaC  42.95 
 
 		 448 aa  332  9e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00196781  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1978  Na+/H+ antiporter NhaC  42.03 
 
 		 464 aa  331  2e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331673 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1898  Na+/H+ antiporter NhaC  42.83 
 
 		 453 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0935892  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1068  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  44.92 
 
 		 440 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000122266  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29770  putative transporter  42.31 
 
 		 441 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000647538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2547  putative transporter  42.31 
 
 		 441 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3556  Na+/H+ antiporter NhaC  42.27 
 
 		 439 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2218  Na+/H+ antiporter NhaC  42.73 
 
 		 439 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2075  Na+/H+ antiporter NhaC  42.27 
 
 		 439 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.355597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2366  Na+/H+ antiporter NhaC  42.73 
 
 		 439 aa  299  8e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3769  Na+/H+ antiporter NhaC  40.82 
 
 		 438 aa  294  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1999  Na+/H+ antiporter NhaC  41.82 
 
 		 439 aa  292  8e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00435268  normal  0.0272999 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0943  Na+ antiporter NhaC  36.64 
 
 		 448 aa  285  1.0000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.629306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1343  Na+/H+ antiporter NhaC  37.78 
 
 		 438 aa  276  5e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014842  hitchhiker  0.000383483 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2679  Na+/H+ antiporter NhaC  34.01 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.468858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0921  Na+/H+ antiporter NhaC  28.07 
 
 		 513 aa  56.2  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000452516  hitchhiker  5.2738399999999995e-21 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01104  Na+/H+ antiporter  34.03 
 
 		 455 aa  55.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1623  Na+/H+ antiporter NhaC  22.99 
 
 		 470 aa  53.1  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2454  Na+/H+ antiporter NhaC  30.82 
 
 		 438 aa  52.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.406393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1419  Na(+)/H(+) antiporter family protein  27.88 
 
 		 567 aa  50.4  0.00006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000092827  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2649  Na+/H+ antiporter NhaC  29.66 
 
 		 510 aa  50.4  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19140  Na+/H+ antiporter NhaC  28.57 
 
 		 521 aa  48.9  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000186366  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2242  Na+/H+ antiporter NhaC  31.97 
 
 		 461 aa  47.8  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.49641 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0924  Na+/H+ antiporter NhaC  34.93 
 
 		 445 aa  47.8  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1405  Na(+)/H(+) antiporter family protein  27.37 
 
 		 567 aa  46.2  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.165118  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0919  Na+/H+ antiporter NhaC  33.56 
 
 		 445 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0324061  normal  0.890337 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0954  Na+/H+ antiporter NhaC  33.56 
 
 		 445 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0132294  normal  0.214654 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0918  Na+/H+ antiporter NhaC  33.56 
 
 		 445 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00150537  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1087  Na+/H+ antiporter family protein  33.56 
 
 		 445 aa  45.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  30.4 
 
 		 517 aa  45.1  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1375  Na(+)/H(+) antiporter family protein  27.54 
 
 		 557 aa  44.7  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3178  Na+/H+ antiporter NhaC  36 
 
 		 443 aa  44.7  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1578  Na+/H+ antiporter NhaC  28.09 
 
 		 434 aa  44.3  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000332533  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  22.84 
 
 		 507 aa  43.1  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4057  Na+/H+ antiporter NhaC  27.85 
 
 		 497 aa  43.1  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1377  Na+/H+ antiporter NhaC  29.65 
 
 		 541 aa  43.1  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>