70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2075 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3556  Na+/H+ antiporter NhaC  95.67 
 
 		 439 aa  757    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0056  Na+/H+ antiporter NhaC  72.62 
 
 		 440 aa  643    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.455554  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29770  putative transporter  80.54 
 
 		 441 aa  635    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000647538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2218  Na+/H+ antiporter NhaC  95.9 
 
 		 439 aa  758    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3769  Na+/H+ antiporter NhaC  85.65 
 
 		 438 aa  684    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2075  Na+/H+ antiporter NhaC  100 
 
 		 439 aa  860    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.355597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2366  Na+/H+ antiporter NhaC  96.81 
 
 		 439 aa  761    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1999  Na+/H+ antiporter NhaC  82 
 
 		 439 aa  626  1e-178  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00435268  normal  0.0272999 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2547  putative transporter  80.09 
 
 		 441 aa  619  1e-176  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1898  Na+/H+ antiporter NhaC  59.82 
 
 		 453 aa  514  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0935892  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1861  sodium/proton antiporter  60.05 
 
 		 442 aa  504  1e-141  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02993  hypothetical protein  58.24 
 
 		 431 aa  503  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0526  hypothetical protein  59.18 
 
 		 441 aa  504  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2095  hypothetical protein  58.41 
 
 		 440 aa  497  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.425927  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3845  Na+/H+ antiporter  55.23 
 
 		 439 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2542  Na+/H+ antiporter NhaC  59.77 
 
 		 439 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000174807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2575  Na+/H+ antiporter NhaC  56.14 
 
 		 439 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000723865  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2449  Na+/H+ antiporter NhaC  59.32 
 
 		 439 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00774297  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2377  Na+/H+ antiporter NhaC  59.09 
 
 		 439 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00605411  normal  0.730196 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1978  Na+/H+ antiporter NhaC  56.59 
 
 		 464 aa  494  9.999999999999999e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331673 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4127  hypothetical protein  55 
 
 		 439 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00423015 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002937  hypothetical protein  58.49 
 
 		 425 aa  491  9.999999999999999e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000304263  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4325  hypothetical protein  55 
 
 		 439 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.895738  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2757  hypothetical protein  59.32 
 
 		 439 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4012  hypothetical protein  55 
 
 		 439 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1515  Na+/H+ antiporter NhaC  57.05 
 
 		 439 aa  490  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000563518  normal  0.487296 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0887  Na+/H+ antiporter NhaC  56.85 
 
 		 446 aa  489  1e-137  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.801907  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2092  Na+/H+ antiporter NhaC  58.2 
 
 		 445 aa  486  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000144395  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2802  Na+ antiporter NhaC  54.32 
 
 		 439 aa  486  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.936373  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1651  Na+/H+ antiporter NhaC  59.65 
 
 		 448 aa  481  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00196781  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1776  Na+/H+ antiporter NhaC  58.64 
 
 		 439 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000109905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1737  Na+/H+ antiporter NhaC  58.64 
 
 		 439 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000126474  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2547  Na+/H+ antiporter NhaC  58.64 
 
 		 439 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000475833  hitchhiker  0.0000000305197 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1733  Na+/H+ antiporter NhaC  58.64 
 
 		 439 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000745905  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3935  Na+/H+ antiporter NhaC  55.91 
 
 		 439 aa  476  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.10264  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4213  hypothetical protein  55.91 
 
 		 439 aa  478  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1024  hypothetical protein  55.68 
 
 		 439 aa  478  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4236  hypothetical protein  55 
 
 		 439 aa  472  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1847  Na+/H+ antiporter NhaC  57.27 
 
 		 439 aa  473  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000629445  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4172  hypothetical protein  55.23 
 
 		 439 aa  473  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3859  Na+/H+ antiporter  55 
 
 		 439 aa  474  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2742  Na+/H+ antiporter NhaC  56.59 
 
 		 439 aa  471  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000444326  hitchhiker  0.000511547 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1454  Na+/H+ antiporter NhaC  57.05 
 
 		 442 aa  474  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1014  permease  52.46 
 
 		 452 aa  467  9.999999999999999e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.747204  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1598  Na+/H+ antiporter NhaC  57.69 
 
 		 439 aa  464  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000151079  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1068  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  56.56 
 
 		 440 aa  449  1e-125  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000122266  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0943  Na+ antiporter NhaC  48.44 
 
 		 448 aa  432  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.629306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0962  Na+ antiporter NhaC  46.14 
 
 		 438 aa  387  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000234758  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1343  Na+/H+ antiporter NhaC  45.64 
 
 		 438 aa  387  1e-106  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014842  hitchhiker  0.000383483 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0943  Na+/H+ antiporter NhaC  46.14 
 
 		 438 aa  387  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000851242  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0529  hypothetical protein  45.27 
 
 		 438 aa  378  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0114104  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2204  Na+/H+ antiporter family protein  46.4 
 
 		 433 aa  363  2e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000124721  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1758  transport protein  42.27 
 
 		 432 aa  340  4e-92  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1749  transport protein  44.72 
 
 		 435 aa  334  2e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.439809  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2039  transport protein  42.3 
 
 		 455 aa  315  9.999999999999999e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0006  Na+/H+ antiporter family protein  42.37 
 
 		 433 aa  315  9.999999999999999e-85  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0435713  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0558  Na+/H+ antiporter family protein  41.1 
 
 		 446 aa  310  4e-83  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000048202 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0006  Na+/H+ antiporter family protein  41.46 
 
 		 433 aa  308  1.0000000000000001e-82  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000950539  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0477  Na+/H+ antiporter NhaC  44.65 
 
 		 434 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0032  Na+/H+ antiporter family protein  42.14 
 
 		 433 aa  301  2e-80  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.540321  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1540  Na+/H+ antiporter family protein  42.96 
 
 		 450 aa  277  3e-73  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1865  citrate transporter  40.78 
 
 		 455 aa  273  4.0000000000000004e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2649  Na+/H+ antiporter NhaC  30.07 
 
 		 510 aa  50.8  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1375  Na(+)/H(+) antiporter family protein  24.75 
 
 		 557 aa  49.7  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19140  Na+/H+ antiporter NhaC  28.17 
 
 		 521 aa  45.8  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000186366  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0853  putative permease protein  23.37 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0845  GntP family permease  22.67 
 
 		 419 aa  45.1  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00379452  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2850  Na+/H+ antiporter family protein  29.52 
 
 		 571 aa  45.1  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2536  Na(+)/H(+) antiporter family protein  28.08 
 
 		 571 aa  44.7  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2593  gluconate permease  25.15 
 
 		 421 aa  43.9  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>