68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3769 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3556  Na+/H+ antiporter NhaC  85.42 
 
 		 439 aa  690    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2366  Na+/H+ antiporter NhaC  86.56 
 
 		 439 aa  690    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2075  Na+/H+ antiporter NhaC  85.65 
 
 		 439 aa  684    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.355597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2218  Na+/H+ antiporter NhaC  85.88 
 
 		 439 aa  695    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0056  Na+/H+ antiporter NhaC  72.05 
 
 		 440 aa  642    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.455554  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3769  Na+/H+ antiporter NhaC  100 
 
 		 438 aa  857    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29770  putative transporter  79.14 
 
 		 441 aa  633  1e-180  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000647538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1999  Na+/H+ antiporter NhaC  82.92 
 
 		 439 aa  627  1e-178  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00435268  normal  0.0272999 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2547  putative transporter  78.91 
 
 		 441 aa  617  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1861  sodium/proton antiporter  60.36 
 
 		 442 aa  507  9.999999999999999e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0526  hypothetical protein  60.63 
 
 		 441 aa  504  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1898  Na+/H+ antiporter NhaC  59.69 
 
 		 453 aa  501  1e-141  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0935892  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2095  hypothetical protein  61.14 
 
 		 440 aa  504  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.425927  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2757  hypothetical protein  60.68 
 
 		 439 aa  498  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1515  Na+/H+ antiporter NhaC  59.55 
 
 		 439 aa  498  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000563518  normal  0.487296 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02993  hypothetical protein  58.24 
 
 		 431 aa  496  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1978  Na+/H+ antiporter NhaC  57.24 
 
 		 464 aa  496  1e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331673 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2377  Na+/H+ antiporter NhaC  60.45 
 
 		 439 aa  497  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00605411  normal  0.730196 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2449  Na+/H+ antiporter NhaC  60.68 
 
 		 439 aa  498  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00774297  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0887  Na+/H+ antiporter NhaC  58.88 
 
 		 446 aa  498  1e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.801907  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3845  Na+/H+ antiporter  55.45 
 
 		 439 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2575  Na+/H+ antiporter NhaC  57.27 
 
 		 439 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000723865  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2542  Na+/H+ antiporter NhaC  60.91 
 
 		 439 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000174807  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4012  hypothetical protein  55.23 
 
 		 439 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4325  hypothetical protein  55.23 
 
 		 439 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.895738  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2092  Na+/H+ antiporter NhaC  59.1 
 
 		 445 aa  488  1e-137  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000144395  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4127  hypothetical protein  55.23 
 
 		 439 aa  490  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00423015 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002937  hypothetical protein  58.49 
 
 		 425 aa  491  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000304263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1776  Na+/H+ antiporter NhaC  60.23 
 
 		 439 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000109905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2547  Na+/H+ antiporter NhaC  60.23 
 
 		 439 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000475833  hitchhiker  0.0000000305197 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1737  Na+/H+ antiporter NhaC  60.23 
 
 		 439 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000126474  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1733  Na+/H+ antiporter NhaC  60.23 
 
 		 439 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000745905  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2802  Na+ antiporter NhaC  54.77 
 
 		 439 aa  481  1e-135  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.936373  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1454  Na+/H+ antiporter NhaC  57.95 
 
 		 442 aa  476  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1024  hypothetical protein  55.23 
 
 		 439 aa  474  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3859  Na+/H+ antiporter  55.23 
 
 		 439 aa  474  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4236  hypothetical protein  55.23 
 
 		 439 aa  471  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1651  Na+/H+ antiporter NhaC  59.91 
 
 		 448 aa  473  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00196781  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4213  hypothetical protein  55.23 
 
 		 439 aa  474  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1598  Na+/H+ antiporter NhaC  59.05 
 
 		 439 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000151079  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1847  Na+/H+ antiporter NhaC  58.64 
 
 		 439 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000629445  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4172  hypothetical protein  55 
 
 		 439 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3935  Na+/H+ antiporter NhaC  55.45 
 
 		 439 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.10264  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2742  Na+/H+ antiporter NhaC  57.95 
 
 		 439 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000444326  hitchhiker  0.000511547 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1014  permease  52.12 
 
 		 452 aa  457  1e-127  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.747204  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1068  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  56.56 
 
 		 440 aa  441  9.999999999999999e-123  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000122266  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0943  Na+ antiporter NhaC  47.32 
 
 		 448 aa  414  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.629306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0962  Na+ antiporter NhaC  46.47 
 
 		 438 aa  384  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000234758  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0529  hypothetical protein  46.47 
 
 		 438 aa  384  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0114104  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0943  Na+/H+ antiporter NhaC  46.47 
 
 		 438 aa  384  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000851242  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1343  Na+/H+ antiporter NhaC  45.54 
 
 		 438 aa  375  1e-103  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014842  hitchhiker  0.000383483 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2204  Na+/H+ antiporter family protein  47.32 
 
 		 433 aa  359  6e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000124721  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1758  transport protein  40.82 
 
 		 432 aa  335  1e-90  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1749  transport protein  42.76 
 
 		 435 aa  319  7.999999999999999e-86  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.439809  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0477  Na+/H+ antiporter NhaC  45.1 
 
 		 434 aa  316  6e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0006  Na+/H+ antiporter family protein  42.14 
 
 		 433 aa  312  1e-83  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0435713  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2039  transport protein  43.07 
 
 		 455 aa  309  5.9999999999999995e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0006  Na+/H+ antiporter family protein  41.46 
 
 		 433 aa  307  2.0000000000000002e-82  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000950539  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0558  Na+/H+ antiporter family protein  40.68 
 
 		 446 aa  304  2.0000000000000002e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000048202 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0032  Na+/H+ antiporter family protein  41.91 
 
 		 433 aa  297  3e-79  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.540321  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1865  citrate transporter  41.68 
 
 		 455 aa  278  1e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1540  Na+/H+ antiporter family protein  43.22 
 
 		 450 aa  273  3e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2649  Na+/H+ antiporter NhaC  30.56 
 
 		 510 aa  49.7  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1375  Na(+)/H(+) antiporter family protein  25.74 
 
 		 557 aa  49.7  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  28.47 
 
 		 517 aa  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  23.29 
 
 		 507 aa  45.8  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19140  Na+/H+ antiporter NhaC  29.41 
 
 		 521 aa  43.5  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000186366  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1066  Na+/H+ antiporter NhaC  28.11 
 
 		 574 aa  43.5  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000104071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>