69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_29770 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2075  Na+/H+ antiporter NhaC  80.54 
 
 		 439 aa  640    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.355597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2547  putative transporter  96.6 
 
 		 441 aa  743    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2218  Na+/H+ antiporter NhaC  80.05 
 
 		 439 aa  640    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1999  Na+/H+ antiporter NhaC  83.45 
 
 		 439 aa  640    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00435268  normal  0.0272999 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0056  Na+/H+ antiporter NhaC  75.51 
 
 		 440 aa  672    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.455554  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29770  putative transporter  100 
 
 		 441 aa  862    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000647538  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3556  Na+/H+ antiporter NhaC  79.41 
 
 		 439 aa  634  1e-180  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3769  Na+/H+ antiporter NhaC  79.14 
 
 		 438 aa  633  1e-180  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2366  Na+/H+ antiporter NhaC  80.09 
 
 		 439 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2095  hypothetical protein  61.94 
 
 		 440 aa  528  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.425927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1861  sodium/proton antiporter  60.72 
 
 		 442 aa  518  1e-146  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2575  Na+/H+ antiporter NhaC  58.96 
 
 		 439 aa  518  1e-146  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000723865  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0526  hypothetical protein  61.09 
 
 		 441 aa  515  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02993  hypothetical protein  60.42 
 
 		 431 aa  514  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1515  Na+/H+ antiporter NhaC  58.73 
 
 		 439 aa  513  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000563518  normal  0.487296 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2542  Na+/H+ antiporter NhaC  60.54 
 
 		 439 aa  511  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000174807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2377  Na+/H+ antiporter NhaC  60.09 
 
 		 439 aa  511  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00605411  normal  0.730196 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2449  Na+/H+ antiporter NhaC  60.32 
 
 		 439 aa  511  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00774297  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2757  hypothetical protein  59.86 
 
 		 439 aa  508  1e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002937  hypothetical protein  60.24 
 
 		 425 aa  504  9.999999999999999e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000304263  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1898  Na+/H+ antiporter NhaC  58.68 
 
 		 453 aa  505  9.999999999999999e-143  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0935892  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0887  Na+/H+ antiporter NhaC  59.28 
 
 		 446 aa  507  9.999999999999999e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.801907  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1847  Na+/H+ antiporter NhaC  60.32 
 
 		 439 aa  498  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000629445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2092  Na+/H+ antiporter NhaC  58.07 
 
 		 445 aa  498  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000144395  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1454  Na+/H+ antiporter NhaC  58.28 
 
 		 442 aa  499  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1737  Na+/H+ antiporter NhaC  59.18 
 
 		 439 aa  497  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000126474  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1733  Na+/H+ antiporter NhaC  59.18 
 
 		 439 aa  497  1e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000745905  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2547  Na+/H+ antiporter NhaC  59.18 
 
 		 439 aa  497  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000475833  hitchhiker  0.0000000305197 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1776  Na+/H+ antiporter NhaC  59.18 
 
 		 439 aa  497  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000109905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4127  hypothetical protein  54.42 
 
 		 439 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00423015 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2742  Na+/H+ antiporter NhaC  59.64 
 
 		 439 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000444326  hitchhiker  0.000511547 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3845  Na+/H+ antiporter  54.65 
 
 		 439 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2802  Na+ antiporter NhaC  54.88 
 
 		 439 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.936373  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1978  Na+/H+ antiporter NhaC  56.34 
 
 		 464 aa  488  1e-137  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331673 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4012  hypothetical protein  53.97 
 
 		 439 aa  487  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1651  Na+/H+ antiporter NhaC  60.44 
 
 		 448 aa  487  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00196781  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4325  hypothetical protein  53.97 
 
 		 439 aa  487  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.895738  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1598  Na+/H+ antiporter NhaC  58.5 
 
 		 439 aa  481  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000151079  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4213  hypothetical protein  54.65 
 
 		 439 aa  476  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1024  hypothetical protein  54.65 
 
 		 439 aa  477  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3935  Na+/H+ antiporter NhaC  54.88 
 
 		 439 aa  475  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.10264  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4236  hypothetical protein  54.42 
 
 		 439 aa  473  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3859  Na+/H+ antiporter  54.42 
 
 		 439 aa  474  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4172  hypothetical protein  54.2 
 
 		 439 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1014  permease  52.56 
 
 		 452 aa  462  1e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.747204  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1068  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  57.14 
 
 		 440 aa  457  1e-127  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000122266  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0943  Na+ antiporter NhaC  48 
 
 		 448 aa  432  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.629306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0962  Na+ antiporter NhaC  47.06 
 
 		 438 aa  397  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000234758  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0943  Na+/H+ antiporter NhaC  47.06 
 
 		 438 aa  397  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000851242  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0529  hypothetical protein  46.61 
 
 		 438 aa  390  1e-107  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0114104  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1343  Na+/H+ antiporter NhaC  44.85 
 
 		 438 aa  386  1e-106  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014842  hitchhiker  0.000383483 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2204  Na+/H+ antiporter family protein  47.1 
 
 		 433 aa  361  1e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000124721  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1758  transport protein  42.31 
 
 		 432 aa  348  9e-95  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0477  Na+/H+ antiporter NhaC  46.71 
 
 		 434 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1749  transport protein  45.21 
 
 		 435 aa  336  5e-91  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.439809  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2039  transport protein  42.46 
 
 		 455 aa  329  6e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0006  Na+/H+ antiporter family protein  42.73 
 
 		 433 aa  325  9e-88  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0435713  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0006  Na+/H+ antiporter family protein  41.59 
 
 		 433 aa  318  1e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000950539  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0558  Na+/H+ antiporter family protein  41.46 
 
 		 446 aa  316  4e-85  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000048202 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0032  Na+/H+ antiporter family protein  42.05 
 
 		 433 aa  310  2e-83  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.540321  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1865  citrate transporter  41.81 
 
 		 455 aa  291  2e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1540  Na+/H+ antiporter family protein  42.5 
 
 		 450 aa  276  7e-73  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0853  putative permease protein  23 
 
 		 419 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0845  GntP family permease  23.39 
 
 		 419 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00379452  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  28.68 
 
 		 517 aa  47.8  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2649  Na+/H+ antiporter NhaC  29.05 
 
 		 510 aa  47  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0614  Na+/H+ antiporter NhaC  29.45 
 
 		 518 aa  45.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.101313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  25 
 
 		 507 aa  43.9  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0994  TRAP transporter  28.68 
 
 		 639 aa  43.5  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.166639  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>