97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0558 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0558  Na+/H+ antiporter family protein  100 
 
 		 446 aa  886    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000048202 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1758  transport protein  47.02 
 
 		 432 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1749  transport protein  49.32 
 
 		 435 aa  412  1e-114  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.439809  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2039  transport protein  48.1 
 
 		 455 aa  402  1e-111  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2204  Na+/H+ antiporter family protein  48.86 
 
 		 433 aa  392  1e-108  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000124721  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0006  Na+/H+ antiporter family protein  45.06 
 
 		 433 aa  375  1e-103  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0435713  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0006  Na+/H+ antiporter family protein  45.06 
 
 		 433 aa  377  1e-103  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000950539  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0477  Na+/H+ antiporter NhaC  45.81 
 
 		 434 aa  366  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1865  citrate transporter  45.56 
 
 		 455 aa  365  1e-100  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0032  Na+/H+ antiporter family protein  45.06 
 
 		 433 aa  366  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.540321  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3845  Na+/H+ antiporter  43.41 
 
 		 439 aa  352  7e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1014  permease  43.2 
 
 		 452 aa  352  8.999999999999999e-96  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.747204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4127  hypothetical protein  43.18 
 
 		 439 aa  351  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00423015 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0887  Na+/H+ antiporter NhaC  44.34 
 
 		 446 aa  348  8e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.801907  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02993  hypothetical protein  45.6 
 
 		 431 aa  348  1e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4172  hypothetical protein  44.09 
 
 		 439 aa  347  3e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4012  hypothetical protein  42.5 
 
 		 439 aa  346  4e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4325  hypothetical protein  42.5 
 
 		 439 aa  346  4e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.895738  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2802  Na+ antiporter NhaC  42.82 
 
 		 439 aa  345  1e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.936373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1024  hypothetical protein  43.64 
 
 		 439 aa  343  4e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3935  Na+/H+ antiporter NhaC  43.05 
 
 		 439 aa  343  5e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.10264  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4213  hypothetical protein  43.64 
 
 		 439 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0526  hypothetical protein  43.86 
 
 		 441 aa  342  8e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002937  hypothetical protein  45.28 
 
 		 425 aa  342  9e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000304263  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1861  sodium/proton antiporter  44.19 
 
 		 442 aa  342  1e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3859  Na+/H+ antiporter  43.41 
 
 		 439 aa  342  1e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1898  Na+/H+ antiporter NhaC  43.08 
 
 		 453 aa  341  1e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0935892  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4236  hypothetical protein  43.41 
 
 		 439 aa  342  1e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2095  hypothetical protein  43.41 
 
 		 440 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.425927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2575  Na+/H+ antiporter NhaC  42.01 
 
 		 439 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000723865  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1515  Na+/H+ antiporter NhaC  42.6 
 
 		 439 aa  332  8e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000563518  normal  0.487296 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2449  Na+/H+ antiporter NhaC  43.15 
 
 		 439 aa  330  3e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00774297  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1540  Na+/H+ antiporter family protein  47.01 
 
 		 450 aa  330  5.0000000000000004e-89  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2377  Na+/H+ antiporter NhaC  42.92 
 
 		 439 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00605411  normal  0.730196 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1978  Na+/H+ antiporter NhaC  41.43 
 
 		 464 aa  329  6e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331673 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0056  Na+/H+ antiporter NhaC  41.23 
 
 		 440 aa  327  2.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.455554  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1651  Na+/H+ antiporter NhaC  41.8 
 
 		 448 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00196781  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2092  Na+/H+ antiporter NhaC  44.24 
 
 		 445 aa  324  2e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000144395  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1068  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  45.5 
 
 		 440 aa  323  3e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000122266  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2742  Na+/H+ antiporter NhaC  42.37 
 
 		 439 aa  323  3e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000444326  hitchhiker  0.000511547 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2757  hypothetical protein  42.37 
 
 		 439 aa  322  6e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2542  Na+/H+ antiporter NhaC  42.14 
 
 		 439 aa  319  7.999999999999999e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000174807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1847  Na+/H+ antiporter NhaC  42.47 
 
 		 439 aa  316  6e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000629445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1737  Na+/H+ antiporter NhaC  41.32 
 
 		 439 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000126474  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1733  Na+/H+ antiporter NhaC  41.32 
 
 		 439 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000745905  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1776  Na+/H+ antiporter NhaC  41.32 
 
 		 439 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000109905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2547  Na+/H+ antiporter NhaC  41.32 
 
 		 439 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000475833  hitchhiker  0.0000000305197 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0943  Na+/H+ antiporter NhaC  38.95 
 
 		 438 aa  313  4.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000851242  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0962  Na+ antiporter NhaC  38.95 
 
 		 438 aa  313  4.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000234758  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1454  Na+/H+ antiporter NhaC  41.57 
 
 		 442 aa  312  9e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0529  hypothetical protein  38.04 
 
 		 438 aa  309  8e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0114104  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1598  Na+/H+ antiporter NhaC  41.32 
 
 		 439 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000151079  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29770  putative transporter  41.23 
 
 		 441 aa  286  5e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000647538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2547  putative transporter  41.23 
 
 		 441 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2075  Na+/H+ antiporter NhaC  41.1 
 
 		 439 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.355597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0943  Na+ antiporter NhaC  34.99 
 
 		 448 aa  279  7e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.629306  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3556  Na+/H+ antiporter NhaC  40.64 
 
 		 439 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2218  Na+/H+ antiporter NhaC  40.41 
 
 		 439 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2366  Na+/H+ antiporter NhaC  40.18 
 
 		 439 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1343  Na+/H+ antiporter NhaC  35.86 
 
 		 438 aa  273  6e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014842  hitchhiker  0.000383483 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3769  Na+/H+ antiporter NhaC  40.77 
 
 		 438 aa  272  7e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1999  Na+/H+ antiporter NhaC  40.87 
 
 		 439 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00435268  normal  0.0272999 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01104  Na+/H+ antiporter  34.59 
 
 		 455 aa  60.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1022  Na+/H+ antiporter NhaC  35.58 
 
 		 439 aa  53.1  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000105643  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2679  Na+/H+ antiporter NhaC  31.73 
 
 		 442 aa  51.6  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.468858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0273  Na+/H+ antiporter NhaC  28 
 
 		 475 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0717657 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2454  Na+/H+ antiporter NhaC  33.65 
 
 		 438 aa  50.1  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.406393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2935  Na+/H+ antiporter family protein  29.38 
 
 		 445 aa  48.9  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0881293 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1445  Na+/H+ antiporter NhaC  31.43 
 
 		 441 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.530014  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0919  Na+/H+ antiporter NhaC  30.57 
 
 		 445 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0324061  normal  0.890337 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1087  Na+/H+ antiporter family protein  30.57 
 
 		 445 aa  47.8  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0954  Na+/H+ antiporter NhaC  30.57 
 
 		 445 aa  47.8  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0132294  normal  0.214654 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0918  Na+/H+ antiporter NhaC  30.57 
 
 		 445 aa  47.8  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00150537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1155  Na+ antiporter NhaC  27.69 
 
 		 494 aa  47  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.886487  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2394  Na+ antiporter NhaC  26.92 
 
 		 459 aa  46.6  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2351  Na+/H+ antiporter NhaC  26.92 
 
 		 459 aa  46.6  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3178  Na+/H+ antiporter NhaC  30.57 
 
 		 443 aa  46.6  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2242  Na+/H+ antiporter NhaC  33.33 
 
 		 461 aa  46.2  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.49641 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01870  Na+/H+ antiporter  33.65 
 
 		 458 aa  45.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1357  Na+/H+ antiporter NhaC  27.69 
 
 		 438 aa  45.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000473106  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1557  Na+/H+ antiporter family protein  27.69 
 
 		 493 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000408774  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0321  Na+/H+ antiporter NhaC  29.8 
 
 		 473 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1596  Na+/H+ antiporter family protein  27.69 
 
 		 438 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000572024  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0435  Na+/H+ antiporter NhaC  29.8 
 
 		 473 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1419  Na(+)/H(+) antiporter family protein  25.87 
 
 		 567 aa  44.3  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000092827  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0372  Na+/H+ antiporter NhaC  29.8 
 
 		 473 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1995  Na+/H+ antiporter NhaC  28.86 
 
 		 506 aa  44.7  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00594855  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0435  Na+/H+ antiporter NhaC  29.8 
 
 		 473 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00534613  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0313  Na+/H+ antiporter  29.8 
 
 		 473 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000868354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0310  Na+/H+ antiporter  29.8 
 
 		 473 aa  44.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.186537  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1400  Na+/H+ antiporter NhaC  29.61 
 
 		 509 aa  44.3  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.226086  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  30 
 
 		 517 aa  43.9  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0924  Na+/H+ antiporter NhaC  30.6 
 
 		 445 aa  44.3  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0388  Na+/H+ antiporter NhaC  29.8 
 
 		 473 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0450556  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2457  Na+/H+ antiporter NhaC  28.57 
 
 		 494 aa  43.5  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1578  Na+/H+ antiporter NhaC  28.95 
 
 		 434 aa  43.5  0.008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000332533  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1375  Na(+)/H(+) antiporter family protein  29.11 
 
 		 557 aa  43.5  0.008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>