73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_2039 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1865  citrate transporter  81.1 
 
 
455 aa  683    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2039  transport protein  100 
 
 
455 aa  894    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1749  transport protein  69.56 
 
 
435 aa  601  1.0000000000000001e-171  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.439809  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1758  transport protein  59.73 
 
 
432 aa  523  1e-147  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0006  Na+/H+ antiporter family protein  54.95 
 
 
433 aa  463  1e-129  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0435713  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0006  Na+/H+ antiporter family protein  54.39 
 
 
433 aa  460  9.999999999999999e-129  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000950539  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0032  Na+/H+ antiporter family protein  54.51 
 
 
433 aa  442  1e-123  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.540321  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2204  Na+/H+ antiporter family protein  51.11 
 
 
433 aa  431  1e-119  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000124721  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0477  Na+/H+ antiporter NhaC  53.41 
 
 
434 aa  411  1e-113  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1540  Na+/H+ antiporter family protein  51.64 
 
 
450 aa  410  1e-113  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0558  Na+/H+ antiporter family protein  48.32 
 
 
446 aa  396  1e-109  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000048202 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02993  hypothetical protein  47.25 
 
 
431 aa  362  7.0000000000000005e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002937  hypothetical protein  49.53 
 
 
425 aa  360  2e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000304263  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3845  Na+/H+ antiporter  44.03 
 
 
439 aa  360  3e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4127  hypothetical protein  43.82 
 
 
439 aa  359  6e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00423015 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4012  hypothetical protein  43.6 
 
 
439 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4325  hypothetical protein  43.6 
 
 
439 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.895738  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4213  hypothetical protein  43.82 
 
 
439 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1024  hypothetical protein  43.82 
 
 
439 aa  356  5e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3859  Na+/H+ antiporter  43.82 
 
 
439 aa  354  1e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4172  hypothetical protein  43.82 
 
 
439 aa  353  4e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4236  hypothetical protein  43.38 
 
 
439 aa  352  7e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3935  Na+/H+ antiporter NhaC  43.38 
 
 
439 aa  352  1e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.10264  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2802  Na+ antiporter NhaC  42.95 
 
 
439 aa  350  2e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.936373  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2449  Na+/H+ antiporter NhaC  45.89 
 
 
439 aa  349  6e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00774297  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2575  Na+/H+ antiporter NhaC  43.72 
 
 
439 aa  348  8e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000723865  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2377  Na+/H+ antiporter NhaC  45.67 
 
 
439 aa  348  9e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00605411  normal  0.730196 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1861  sodium/proton antiporter  43.87 
 
 
442 aa  347  2e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2757  hypothetical protein  45.67 
 
 
439 aa  346  5e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2542  Na+/H+ antiporter NhaC  45.67 
 
 
439 aa  345  1e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000174807  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0526  hypothetical protein  45.47 
 
 
441 aa  345  1e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1515  Na+/H+ antiporter NhaC  44.81 
 
 
439 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000563518  normal  0.487296 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1014  permease  43.88 
 
 
452 aa  343  4e-93  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.747204  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2547  Na+/H+ antiporter NhaC  45.02 
 
 
439 aa  343  5e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000475833  hitchhiker  0.0000000305197 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1737  Na+/H+ antiporter NhaC  45.02 
 
 
439 aa  343  5e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000126474  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1733  Na+/H+ antiporter NhaC  45.02 
 
 
439 aa  343  5e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000745905  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1776  Na+/H+ antiporter NhaC  45.02 
 
 
439 aa  343  5e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000109905  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2095  hypothetical protein  43.51 
 
 
440 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.425927  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0056  Na+/H+ antiporter NhaC  42.55 
 
 
440 aa  335  7e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.455554  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1598  Na+/H+ antiporter NhaC  44.37 
 
 
439 aa  335  9e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000151079  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0887  Na+/H+ antiporter NhaC  44.73 
 
 
446 aa  335  1e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.801907  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2742  Na+/H+ antiporter NhaC  43.72 
 
 
439 aa  331  1e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000444326  hitchhiker  0.000511547 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1847  Na+/H+ antiporter NhaC  44.37 
 
 
439 aa  330  3e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000629445  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1898  Na+/H+ antiporter NhaC  42.95 
 
 
453 aa  328  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0935892  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2092  Na+/H+ antiporter NhaC  44.4 
 
 
445 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000144395  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1454  Na+/H+ antiporter NhaC  44.11 
 
 
442 aa  319  7e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1651  Na+/H+ antiporter NhaC  45.83 
 
 
448 aa  317  3e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00196781  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0962  Na+ antiporter NhaC  39.91 
 
 
438 aa  310  4e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000234758  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1978  Na+/H+ antiporter NhaC  40.21 
 
 
464 aa  310  4e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.331673 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0943  Na+/H+ antiporter NhaC  39.91 
 
 
438 aa  310  4e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000851242  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0529  hypothetical protein  39.7 
 
 
438 aa  306  5.0000000000000004e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0114104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29770  putative transporter  42.03 
 
 
441 aa  297  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000647538  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1068  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  44.37 
 
 
440 aa  297  3e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000122266  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2547  putative transporter  42.46 
 
 
441 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3556  Na+/H+ antiporter NhaC  46.72 
 
 
439 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2366  Na+/H+ antiporter NhaC  46.72 
 
 
439 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2075  Na+/H+ antiporter NhaC  47.22 
 
 
439 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.355597  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2218  Na+/H+ antiporter NhaC  46.21 
 
 
439 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1999  Na+/H+ antiporter NhaC  43.29 
 
 
439 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00435268  normal  0.0272999 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3769  Na+/H+ antiporter NhaC  42.86 
 
 
438 aa  278  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0943  Na+ antiporter NhaC  37.98 
 
 
448 aa  275  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.629306  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1343  Na+/H+ antiporter NhaC  38.36 
 
 
438 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014842  hitchhiker  0.000383483 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06095  C4-dicarboxylate transporter DcuC  25.59 
 
 
455 aa  52.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2679  Na+/H+ antiporter NhaC  32.45 
 
 
442 aa  49.7  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.468858  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0857  C4-dicarboxylate transporter DcuC  24.88 
 
 
455 aa  49.3  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.510054  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1375  Na(+)/H(+) antiporter family protein  28.21 
 
 
557 aa  47.8  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19140  Na+/H+ antiporter NhaC  27.17 
 
 
521 aa  47.8  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000186366  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  27.94 
 
 
517 aa  46.2  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2454  Na+/H+ antiporter NhaC  30.46 
 
 
438 aa  46.2  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.406393  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01104  Na+/H+ antiporter  32.68 
 
 
455 aa  46.2  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0607  C4-dicarboxylate transporter DcuC  24.27 
 
 
459 aa  45.8  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1791  Na+/H+ antiporter NhaC  31.69 
 
 
393 aa  45.8  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1022  Na+/H+ antiporter NhaC  32.71 
 
 
439 aa  45.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000105643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>