72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1343 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1343  Na+/H+ antiporter NhaC  100 
 
 		 438 aa  864    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014842  hitchhiker  0.000383483 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0943  Na+ antiporter NhaC  66.13 
 
 		 448 aa  590  1e-167  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.629306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1651  Na+/H+ antiporter NhaC  52.59 
 
 		 448 aa  418  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00196781  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2095  hypothetical protein  47.95 
 
 		 440 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.425927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1515  Na+/H+ antiporter NhaC  46.9 
 
 		 439 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000563518  normal  0.487296 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02993  hypothetical protein  46.56 
 
 		 431 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2757  hypothetical protein  47.61 
 
 		 439 aa  397  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2542  Na+/H+ antiporter NhaC  47.27 
 
 		 439 aa  395  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000174807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002937  hypothetical protein  47.44 
 
 		 425 aa  396  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000304263  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2377  Na+/H+ antiporter NhaC  47.05 
 
 		 439 aa  395  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00605411  normal  0.730196 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1776  Na+/H+ antiporter NhaC  47.73 
 
 		 439 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000109905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2547  Na+/H+ antiporter NhaC  47.73 
 
 		 439 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000475833  hitchhiker  0.0000000305197 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1737  Na+/H+ antiporter NhaC  47.73 
 
 		 439 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000126474  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1454  Na+/H+ antiporter NhaC  47.24 
 
 		 442 aa  394  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2449  Na+/H+ antiporter NhaC  46.82 
 
 		 439 aa  395  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00774297  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1733  Na+/H+ antiporter NhaC  47.73 
 
 		 439 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000745905  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2575  Na+/H+ antiporter NhaC  46.59 
 
 		 439 aa  394  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000723865  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1014  permease  46.7 
 
 		 452 aa  388  1e-107  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.747204  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1861  sodium/proton antiporter  45.29 
 
 		 442 aa  390  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1847  Na+/H+ antiporter NhaC  48.05 
 
 		 439 aa  390  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000629445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0887  Na+/H+ antiporter NhaC  46.22 
 
 		 446 aa  389  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.801907  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2092  Na+/H+ antiporter NhaC  45.8 
 
 		 445 aa  385  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000144395  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0526  hypothetical protein  46.33 
 
 		 441 aa  384  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1598  Na+/H+ antiporter NhaC  47.36 
 
 		 439 aa  383  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000151079  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2742  Na+/H+ antiporter NhaC  48.05 
 
 		 439 aa  378  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000444326  hitchhiker  0.000511547 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1978  Na+/H+ antiporter NhaC  45.05 
 
 		 464 aa  372  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331673 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1898  Na+/H+ antiporter NhaC  45.39 
 
 		 453 aa  372  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0935892  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0056  Na+/H+ antiporter NhaC  44.62 
 
 		 440 aa  362  6e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.455554  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1068  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  46.67 
 
 		 440 aa  353  4e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000122266  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0962  Na+ antiporter NhaC  41.71 
 
 		 438 aa  348  1e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000234758  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0943  Na+/H+ antiporter NhaC  41.71 
 
 		 438 aa  348  1e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000851242  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2218  Na+/H+ antiporter NhaC  45.41 
 
 		 439 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0529  hypothetical protein  41.24 
 
 		 438 aa  341  1e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0114104  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2366  Na+/H+ antiporter NhaC  45.41 
 
 		 439 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3556  Na+/H+ antiporter NhaC  44.95 
 
 		 439 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2075  Na+/H+ antiporter NhaC  45.64 
 
 		 439 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.355597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4127  hypothetical protein  40.83 
 
 		 439 aa  339  5e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00423015 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29770  putative transporter  44.85 
 
 		 441 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000647538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2547  putative transporter  45.64 
 
 		 441 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4012  hypothetical protein  40.6 
 
 		 439 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3845  Na+/H+ antiporter  40.6 
 
 		 439 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4325  hypothetical protein  40.6 
 
 		 439 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.895738  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2802  Na+ antiporter NhaC  40.6 
 
 		 439 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.936373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1024  hypothetical protein  41.28 
 
 		 439 aa  333  3e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4213  hypothetical protein  41.51 
 
 		 439 aa  333  4e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3859  Na+/H+ antiporter  40.83 
 
 		 439 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4172  hypothetical protein  40.83 
 
 		 439 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4236  hypothetical protein  40.83 
 
 		 439 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3935  Na+/H+ antiporter NhaC  40.6 
 
 		 439 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.10264  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3769  Na+/H+ antiporter NhaC  45.54 
 
 		 438 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1999  Na+/H+ antiporter NhaC  44.57 
 
 		 439 aa  312  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00435268  normal  0.0272999 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2204  Na+/H+ antiporter family protein  42.54 
 
 		 433 aa  303  3.0000000000000004e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000124721  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1758  transport protein  37.78 
 
 		 432 aa  276  6e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1749  transport protein  39.58 
 
 		 435 aa  270  5e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.439809  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2039  transport protein  38.36 
 
 		 455 aa  256  6e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0558  Na+/H+ antiporter family protein  36.09 
 
 		 446 aa  251  2e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000048202 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0006  Na+/H+ antiporter family protein  34.84 
 
 		 433 aa  249  5e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0435713  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0006  Na+/H+ antiporter family protein  34.16 
 
 		 433 aa  247  3e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000950539  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0477  Na+/H+ antiporter NhaC  37.14 
 
 		 434 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1540  Na+/H+ antiporter family protein  37.28 
 
 		 450 aa  246  8e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0032  Na+/H+ antiporter family protein  35.07 
 
 		 433 aa  245  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.540321  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1865  citrate transporter  36.77 
 
 		 455 aa  217  2.9999999999999998e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  24.27 
 
 		 507 aa  60.5  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  28.57 
 
 		 517 aa  48.5  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2649  Na+/H+ antiporter NhaC  29.75 
 
 		 510 aa  46.6  0.0009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0897  Na+/H+ antiporter NhaC  26.74 
 
 		 525 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1703  Na+ antiporter NhaC  26.74 
 
 		 525 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01080  Na+/H+ antiporter  26.54 
 
 		 201 aa  43.9  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0208  Na+/H+ antiporter NhaC  26.46 
 
 		 533 aa  43.9  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19140  Na+/H+ antiporter NhaC  27.74 
 
 		 521 aa  43.5  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000186366  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3966  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  34.45 
 
 		 464 aa  43.1  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.352958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12680  Na+/H+ antiporter  32.93 
 
 		 532 aa  43.1  0.01  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.33176  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>