79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0529 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0529  hypothetical protein  100 
 
 		 438 aa  867    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0114104  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0943  Na+/H+ antiporter NhaC  88.13 
 
 		 438 aa  788    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000851242  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0962  Na+ antiporter NhaC  88.13 
 
 		 438 aa  788    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000234758  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2095  hypothetical protein  50.45 
 
 		 440 aa  425  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.425927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1515  Na+/H+ antiporter NhaC  50.57 
 
 		 439 aa  424  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000563518  normal  0.487296 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2802  Na+ antiporter NhaC  47.17 
 
 		 439 aa  412  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.936373  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2377  Na+/H+ antiporter NhaC  50.8 
 
 		 439 aa  412  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00605411  normal  0.730196 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2575  Na+/H+ antiporter NhaC  48.29 
 
 		 439 aa  414  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000723865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3845  Na+/H+ antiporter  46.26 
 
 		 439 aa  412  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2757  hypothetical protein  50.8 
 
 		 439 aa  412  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4012  hypothetical protein  45.8 
 
 		 439 aa  408  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4127  hypothetical protein  46.03 
 
 		 439 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00423015 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2449  Na+/H+ antiporter NhaC  50.57 
 
 		 439 aa  411  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00774297  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4325  hypothetical protein  45.8 
 
 		 439 aa  408  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.895738  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2542  Na+/H+ antiporter NhaC  51.03 
 
 		 439 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000174807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2742  Na+/H+ antiporter NhaC  48.52 
 
 		 439 aa  404  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000444326  hitchhiker  0.000511547 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0526  hypothetical protein  48.64 
 
 		 441 aa  402  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1737  Na+/H+ antiporter NhaC  50.57 
 
 		 439 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000126474  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2547  Na+/H+ antiporter NhaC  50.57 
 
 		 439 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000475833  hitchhiker  0.0000000305197 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1776  Na+/H+ antiporter NhaC  50.57 
 
 		 439 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000109905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1733  Na+/H+ antiporter NhaC  50.57 
 
 		 439 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000745905  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0056  Na+/H+ antiporter NhaC  45.62 
 
 		 440 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.455554  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0887  Na+/H+ antiporter NhaC  48.43 
 
 		 446 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.801907  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2092  Na+/H+ antiporter NhaC  49.78 
 
 		 445 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000144395  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1847  Na+/H+ antiporter NhaC  49.09 
 
 		 439 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000629445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4236  hypothetical protein  46.26 
 
 		 439 aa  396  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3859  Na+/H+ antiporter  46.03 
 
 		 439 aa  398  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4213  hypothetical protein  46.03 
 
 		 439 aa  396  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1024  hypothetical protein  45.8 
 
 		 439 aa  397  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3935  Na+/H+ antiporter NhaC  46.26 
 
 		 439 aa  397  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.10264  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02993  hypothetical protein  47.1 
 
 		 431 aa  394  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4172  hypothetical protein  45.8 
 
 		 439 aa  395  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1898  Na+/H+ antiporter NhaC  47.48 
 
 		 453 aa  389  1e-107  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0935892  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1598  Na+/H+ antiporter NhaC  50.8 
 
 		 439 aa  388  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000151079  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1861  sodium/proton antiporter  46.4 
 
 		 442 aa  391  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002937  hypothetical protein  47.17 
 
 		 425 aa  391  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000304263  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1454  Na+/H+ antiporter NhaC  49.32 
 
 		 442 aa  384  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1014  permease  46.8 
 
 		 452 aa  379  1e-104  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.747204  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1978  Na+/H+ antiporter NhaC  44.61 
 
 		 464 aa  378  1e-103  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331673 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1651  Na+/H+ antiporter NhaC  47.1 
 
 		 448 aa  366  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00196781  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0943  Na+ antiporter NhaC  42.06 
 
 		 448 aa  365  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.629306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1068  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  46.88 
 
 		 440 aa  356  5e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000122266  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29770  putative transporter  46.61 
 
 		 441 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000647538  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3556  Na+/H+ antiporter NhaC  47.73 
 
 		 439 aa  350  4e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1343  Na+/H+ antiporter NhaC  41.24 
 
 		 438 aa  348  1e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014842  hitchhiker  0.000383483 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2218  Na+/H+ antiporter NhaC  47.05 
 
 		 439 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3769  Na+/H+ antiporter NhaC  46.47 
 
 		 438 aa  345  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2204  Na+/H+ antiporter family protein  45.7 
 
 		 433 aa  343  4e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000124721  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2547  putative transporter  46.26 
 
 		 441 aa  341  1e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1999  Na+/H+ antiporter NhaC  47.05 
 
 		 439 aa  342  1e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00435268  normal  0.0272999 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2075  Na+/H+ antiporter NhaC  46.36 
 
 		 439 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.355597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1758  transport protein  42.63 
 
 		 432 aa  340  2.9999999999999998e-92  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2366  Na+/H+ antiporter NhaC  47.27 
 
 		 439 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1749  transport protein  41.78 
 
 		 435 aa  313  3.9999999999999997e-84  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.439809  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0006  Na+/H+ antiporter family protein  39.46 
 
 		 433 aa  301  1e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000950539  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0006  Na+/H+ antiporter family protein  39.91 
 
 		 433 aa  301  1e-80  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0435713  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2039  transport protein  40.35 
 
 		 455 aa  301  2e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0477  Na+/H+ antiporter NhaC  41.53 
 
 		 434 aa  300  3e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0558  Na+/H+ antiporter family protein  38.27 
 
 		 446 aa  292  8e-78  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000048202 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0032  Na+/H+ antiporter family protein  39.91 
 
 		 433 aa  288  2e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.540321  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1865  citrate transporter  40.09 
 
 		 455 aa  272  9e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1540  Na+/H+ antiporter family protein  38.21 
 
 		 450 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0208  hypothetical protein  29.94 
 
 		 569 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0388  Na+/H+ antiporter NhaC  30 
 
 		 473 aa  47  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0450556  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0313  Na+/H+ antiporter  27.98 
 
 		 473 aa  47  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000868354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0310  Na+/H+ antiporter  27.98 
 
 		 473 aa  47  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.186537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0372  Na+/H+ antiporter NhaC  27.98 
 
 		 473 aa  47  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0435  Na+/H+ antiporter NhaC  27.98 
 
 		 473 aa  47  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00534613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0435  Na+/H+ antiporter NhaC  27.98 
 
 		 473 aa  47  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  21.96 
 
 		 507 aa  47  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  27.4 
 
 		 517 aa  46.2  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4931  Na+/H+ antiporter NhaC  31.52 
 
 		 473 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.312276  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0326  Na+/H+ antiporter NhaC  27.98 
 
 		 473 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000241995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0341  Na+/H+ antiporter NhaC  27.98 
 
 		 473 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.142546  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0321  Na+/H+ antiporter NhaC  29.87 
 
 		 473 aa  44.3  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0340  Na+/H+ antiporter NhaC  31.51 
 
 		 467 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.307313  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1507  trap dicarboxylate transporter, dctm subunit  22.53 
 
 		 462 aa  44.3  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1375  Na(+)/H(+) antiporter family protein  25.6 
 
 		 557 aa  43.9  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2536  Na(+)/H(+) antiporter family protein  27.1 
 
 		 571 aa  43.1  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>