53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6587 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6587  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  225  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000000203689  normal  0.0217511 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2756  peptidase M48, Ste24p  46.77 
 
 		 354 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3237  peptidase M48 Ste24p  45.61 
 
 		 378 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2290  peptidase M48 Ste24p  40.35 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.323007 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3691  peptidase M48, Ste24p  47.06 
 
 		 359 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1976  peptidase M48 Ste24p  40.35 
 
 		 373 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88766  normal  0.175052 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2014  peptidase M48 Ste24p  38.6 
 
 		 378 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.700955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6656  putative metalloendopeptidase  41.18 
 
 		 383 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  42.19 
 
 		 436 aa  50.8  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2660  peptidase M48 Ste24p  38.33 
 
 		 395 aa  50.1  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.110854 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  51.22 
 
 		 280 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3399  peptidase M48 Ste24p  42.11 
 
 		 362 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3686  peptidase M48 Ste24p  36.67 
 
 		 383 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3622  peptidase M48 Ste24p  35 
 
 		 383 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3534  peptidase M48, Ste24p  36.67 
 
 		 383 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1396  peptidase M48 Ste24p  36.07 
 
 		 269 aa  48.1  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3623  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  32.31 
 
 		 294 aa  47.4  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.619094  normal  0.846236 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  40 
 
 		 292 aa  46.2  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0670  peptidase M48, Ste24p  44.68 
 
 		 288 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00234542  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  38.71 
 
 		 424 aa  45.4  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0581  peptidase M48 Ste24p  37.29 
 
 		 361 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.380263 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0537  peptidase M48 Ste24p  37.29 
 
 		 364 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0982  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  35.71 
 
 		 312 aa  45.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.165427  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0644  putative transmembrane protein  37.29 
 
 		 358 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  38.33 
 
 		 292 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2828  peptidase M48 Ste24p  38.98 
 
 		 284 aa  43.9  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0462  M48 family peptidase  33.9 
 
 		 357 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169095  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2801  peptidase M48, Ste24p  32.2 
 
 		 341 aa  42.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.57827 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  35.38 
 
 		 504 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  38.46 
 
 		 494 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3510  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  30.91 
 
 		 370 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4669  peptidase M48, Ste24p  48.78 
 
 		 514 aa  41.6  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4143  peptidase M48, Ste24p  34.92 
 
 		 347 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.724866  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0388  peptidase M48 Ste24p  37.74 
 
 		 349 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0132188  normal  0.117009 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  37.31 
 
 		 490 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3919  peptidase M48, Ste24p  46.34 
 
 		 549 aa  41.6  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749041  hitchhiker  0.000945115 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0514  peptidase M48 Ste24p  33.9 
 
 		 343 aa  41.6  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0802067  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  43.9 
 
 		 479 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  33.71 
 
 		 513 aa  40.8  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  43.9 
 
 		 479 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3332  peptidase M48, Ste24p  44.74 
 
 		 268 aa  40.8  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.835171  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1295  peptidase M48, Ste24p  46.15 
 
 		 453 aa  40.8  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.226604  normal  0.704605 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2571  peptidase M48 Ste24p  33.8 
 
 		 473 aa  40.4  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1185  peptidase M48, Ste24p  30.43 
 
 		 228 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.126393  normal  0.840759 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3280  peptidase M48 Ste24p  41.51 
 
 		 452 aa  40.4  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.227869  normal  0.68858 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0246  peptidase M48, Ste24p  31.88 
 
 		 442 aa  40.4  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0070  peptidase M48 Ste24p  30 
 
 		 260 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.885024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  36.92 
 
 		 392 aa  40.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0072  peptidase M48 Ste24p  30 
 
 		 260 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0642  peptidase M48, Ste24p  33.9 
 
 		 347 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  37.04 
 
 		 479 aa  40  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0508  peptidase M48, Ste24p  35 
 
 		 279 aa  40  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2301  peptidase M48 Ste24p  42.5 
 
 		 270 aa  40  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114592  normal  0.277953 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>