More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2709 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_2709  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 		 307 aa  621  1e-177  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  47.39 
 
 		 301 aa  271  1e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  50.65 
 
 		 310 aa  269  5e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1224  cysteine synthase A  49.51 
 
 		 300 aa  268  1e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.47956e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0902  cysteine synthase A  48.04 
 
 		 299 aa  262  4.999999999999999e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000036612  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0990  cysteine synthase A  48.69 
 
 		 299 aa  259  3e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  hitchhiker  0.0058381  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04800  cysteine synthase A  47.06 
 
 		 309 aa  258  7e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000597368  normal  0.814351 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  44.12 
 
 		 304 aa  256  5e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  48.69 
 
 		 310 aa  255  6e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  45.42 
 
 		 310 aa  255  6e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  47.71 
 
 		 309 aa  253  3e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  45.03 
 
 		 304 aa  252  6e-66  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  45.42 
 
 		 304 aa  249  6e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  46.41 
 
 		 302 aa  248  7e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  44.7 
 
 		 307 aa  244  9.999999999999999e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  41.83 
 
 		 321 aa  242  3.9999999999999997e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  45.13 
 
 		 311 aa  241  7.999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1332  cysteine synthase A  45.6 
 
 		 309 aa  241  2e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000281475  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  42.67 
 
 		 304 aa  240  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  43.14 
 
 		 312 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  42.48 
 
 		 312 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1734  cysteine synthase  42.16 
 
 		 301 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.30022  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1322  cysteine synthase A  49.35 
 
 		 300 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353191  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  43.46 
 
 		 307 aa  239  5e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1045  cysteine synthases  44.01 
 
 		 306 aa  239  5e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2286  cysteine synthase A  47.39 
 
 		 309 aa  238  9e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1529  cysteine synthase A  49.02 
 
 		 300 aa  238  1e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000033727  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  40.92 
 
 		 310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  43.46 
 
 		 318 aa  233  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05340  cysteine synthase  41.12 
 
 		 304 aa  231  9e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  44.44 
 
 		 328 aa  231  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  43.14 
 
 		 320 aa  230  2e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  39.34 
 
 		 310 aa  229  4e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  43.71 
 
 		 320 aa  229  4e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  44.95 
 
 		 308 aa  229  4e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  39.34 
 
 		 310 aa  229  4e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4653  cysteine synthase  43.32 
 
 		 306 aa  229  4e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518003  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6147  cysteine synthase A  42.35 
 
 		 305 aa  228  7e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  44.77 
 
 		 308 aa  228  8e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  45.75 
 
 		 311 aa  226  3e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1301  cysteine synthase A  44.95 
 
 		 309 aa  226  3e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.568697 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0832  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  43 
 
 		 306 aa  226  3e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00340267  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6440  cysteine synthase A  41.37 
 
 		 305 aa  225  6e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  44.33 
 
 		 291 aa  225  7e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  44.81 
 
 		 317 aa  225  9e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1589  cysteine synthase  42.35 
 
 		 302 aa  224  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424086  normal  0.274481 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  45.13 
 
 		 311 aa  224  1e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02140  cysteine synthase  41.48 
 
 		 317 aa  224  1e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.445604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  42.02 
 
 		 305 aa  223  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  46.41 
 
 		 327 aa  223  2e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0450  cysteine synthase  41.04 
 
 		 306 aa  224  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  44.19 
 
 		 310 aa  224  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0920  cysteine synthase A  49.61 
 
 		 253 aa  224  2e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000222574  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0149  cysteine synthase  40.91 
 
 		 306 aa  223  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  46.08 
 
 		 309 aa  223  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  44.12 
 
 		 309 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  44.95 
 
 		 329 aa  222  4.9999999999999996e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  41.37 
 
 		 305 aa  222  6e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3398  cysteine synthase A  42.02 
 
 		 307 aa  222  7e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  40.85 
 
 		 320 aa  222  8e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  40.47 
 
 		 311 aa  222  8e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1210  cysteine synthase  42.16 
 
 		 305 aa  221  9e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.473529  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  46.73 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1671  cysteine synthase A  45.42 
 
 		 311 aa  221  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422965  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  43.65 
 
 		 308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0178  cysteine synthase A  46.08 
 
 		 316 aa  219  3e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0627608  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  39.53 
 
 		 303 aa  219  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  46.73 
 
 		 307 aa  220  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  44.44 
 
 		 306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  40.32 
 
 		 302 aa  219  5e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  43 
 
 		 290 aa  219  5e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0162  cysteine synthase  42.33 
 
 		 305 aa  219  5e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2475  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.94 
 
 		 307 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  41.37 
 
 		 305 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3006  cysteine synthase A  42.67 
 
 		 305 aa  218  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.599463  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3723  cysteine synthase  42.67 
 
 		 305 aa  218  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  44.26 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1091  cysteine synthase  43.42 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000826995  decreased coverage  0.00308217 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0865  cysteine synthase  40.72 
 
 		 306 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  42.81 
 
 		 339 aa  217  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1448  cysteine synthase A  45.6 
 
 		 306 aa  217  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2609  cysteine synthase A  44.44 
 
 		 311 aa  216  2.9999999999999998e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  44.63 
 
 		 311 aa  216  2.9999999999999998e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  42.62 
 
 		 307 aa  216  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1390  cysteine synthase  46.08 
 
 		 311 aa  216  4e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  0.100727 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3460  cysteine synthases  42.02 
 
 		 305 aa  216  4e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  43.14 
 
 		 309 aa  216  5e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3549  cysteine synthase A  44.3 
 
 		 322 aa  215  5.9999999999999996e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4297  cysteine synthase  42.35 
 
 		 321 aa  215  5.9999999999999996e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2067  cysteine synthase A  41.94 
 
 		 327 aa  214  9.999999999999999e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197318 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3085  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.56 
 
 		 307 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.520498  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2681  cysteine synthase A  41.83 
 
 		 308 aa  213  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0782138 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0978  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.31 
 
 		 307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26180  cysteine synthase  43.79 
 
 		 309 aa  213  2.9999999999999995e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0170  cysteine synthase family protein  40.39 
 
 		 302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7559  cysteine synthase  36.27 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  47.39 
 
 		 307 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  43.97 
 
 		 308 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  44.81 
 
 		 317 aa  212  7e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5241  cysteine synthase A  47.06 
 
 		 307 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0191728 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>