59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1154 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1154  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  100 
 
 		 112 aa  213  5.9999999999999996e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.583061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2177  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  55.86 
 
 		 110 aa  110  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0242172  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1167  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  45.71 
 
 		 100 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2000  hydrogenase expression/formation  50.5 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.125343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50550  hydrogenase assembly chaperone HoxL (HypC/HupF family)  47.57 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00348713  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3768  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  43.14 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1159  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  44.12 
 
 		 100 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.16504  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7261  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  43.14 
 
 		 102 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.409873  normal  0.408688 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1165  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  47.52 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.297404  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0500  putative HupF/HypC hydrogenase protein  43.75 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3102  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  44.64 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2151  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  41.07 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.188012  normal  0.193487 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1292  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  43.08 
 
 		 100 aa  57  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000883149  normal  0.714979 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1639  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  38.46 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1636  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  38.46 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.668575  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2025  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  46.6 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.306695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3371  hypothetical protein  45.22 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.677522  normal  0.937516 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3969  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  42.11 
 
 		 96 aa  51.2  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1970  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  39.44 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3985  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  40.78 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3924  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  46.67 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.377852  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1961  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.43 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0463  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.67 
 
 		 74 aa  47.4  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604449  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1131  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  32.58 
 
 		 76 aa  47  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1647  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  39.42 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.963071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1706  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  39.42 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.371341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1664  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.473831  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0088  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  39.13 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1801  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  39.42 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.102221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0326  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.96 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00530973  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3131  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40.68 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0177  hydrogenase expression/formation protein  40.28 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3967  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  35.8 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0268  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  39.68 
 
 		 78 aa  44.7  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.123557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2821  hypothetical protein  36.62 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1951  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36.36 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2178  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.27 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.339954 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50460  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  37.33 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0945297  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2490  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  35 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228537 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1600  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2008  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.94 
 
 		 86 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4508  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  34.21 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.701167  normal  0.209775 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3201  hydrogenase assembly chaperone  34.15 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1706  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  30.67 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.296554 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1283  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  36 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.409533 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1381  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  43.14 
 
 		 76 aa  41.2  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00885593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1272  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  45.1 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.444775  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2813  putative hypC  35.44 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02543  hypothetical protein  32.93 
 
 		 90 aa  40.4  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0961  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  32.93 
 
 		 90 aa  40.4  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.775434  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3980  hydrogenase assembly chaperone  32.93 
 
 		 90 aa  40.4  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2853  hydrogenase assembly chaperone  32.93 
 
 		 90 aa  40.4  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.516809 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0984  hydrogenase assembly chaperone  32.93 
 
 		 90 aa  40.4  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.322582 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3016  hydrogenase assembly chaperone  32.93 
 
 		 90 aa  40.4  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2865  hydrogenase assembly chaperone  32.93 
 
 		 90 aa  40.4  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02578  HypC  32.93 
 
 		 90 aa  40.4  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03900  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  31.88 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2594  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  32.89 
 
 		 85 aa  40.4  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1241  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36.21 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>