21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B1636 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B1636  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  100 
 
 		 99 aa  201  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.668575  n/a   
 
 
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NC_011094  SeSA_A1639  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  98.99 
 
 		 99 aa  199  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011205  SeD_A1801  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  97.98 
 
 		 99 aa  179  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.102221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1706  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  97.98 
 
 		 99 aa  179  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.371341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1647  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  97.98 
 
 		 99 aa  179  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.963071  normal  1 
 
 
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NC_010627  Bphy_7261  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40.4 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.409873  normal  0.408688 
 
 
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NC_007298  Daro_3985  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  46.94 
 
 		 100 aa  68.2  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012560  Avin_50550  hydrogenase assembly chaperone HoxL (HypC/HupF family)  38.78 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00348713  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_1159  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40 
 
 		 100 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.16504  n/a   
 
 
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NC_007958  RPD_1167  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40.4 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007643  Rru_A1165  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  39.18 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.297404  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_2177  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  37 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0242172  normal  0.179012 
 
 
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NC_007973  Rmet_1292  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  43.84 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000883149  normal  0.714979 
 
 
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NC_009485  BBta_2000  hydrogenase expression/formation  35.35 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.125343  normal  1 
 
 
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NC_007925  RPC_3768  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36.36 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_1154  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  35.92 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.583061  normal  1 
 
 
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NC_008781  Pnap_1970  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40.24 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008825  Mpe_A2821  hypothetical protein  42.47 
 
 		 110 aa  47.4  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008576  Mmc1_2501  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  33.87 
 
 		 86 aa  47.4  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595307 
 
 
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NC_008687  Pden_3102  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  37.76 
 
 		 103 aa  47  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008340  Mlg_2025  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  37.37 
 
 		 128 aa  43.5  0.0009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.306695  normal  1 
 
 
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