25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_50550 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



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Replicon accession
Locus tag
Product
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Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
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Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_50550  hydrogenase assembly chaperone HoxL (HypC/HupF family)  100 
 
 		 106 aa  206  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00348713  n/a   
 
 
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NC_010627  Bphy_7261  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  46.53 
 
 		 102 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.409873  normal  0.408688 
 
 
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NC_008340  Mlg_2025  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  55 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.306695  normal  1 
 
 
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NC_007298  Daro_3985  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  52.48 
 
 		 100 aa  77.8  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_1159  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  44.9 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.16504  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_2177  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  46.53 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0242172  normal  0.179012 
 
 
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NC_008781  Pnap_1970  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  51.35 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008825  Mpe_A2821  hypothetical protein  47.62 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009049  Rsph17029_2151  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  49 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.188012  normal  0.193487 
 
 
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NC_007493  RSP_0500  putative HupF/HypC hydrogenase protein  48 
 
 		 105 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007958  RPD_1167  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  43 
 
 		 100 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_1154  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  47.57 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.583061  normal  1 
 
 
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NC_008687  Pden_3102  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  45.79 
 
 		 103 aa  65.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007973  Rmet_1292  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  46.43 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000883149  normal  0.714979 
 
 
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NC_007925  RPC_3768  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40.78 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007643  Rru_A1165  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  46.39 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.297404  n/a   
 
 
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NC_011149  SeAg_B1636  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  38.78 
 
 		 99 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.668575  n/a   
 
 
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NC_011094  SeSA_A1639  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  38.78 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_2000  hydrogenase expression/formation  39.8 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.125343  normal  1 
 
 
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NC_009429  Rsph17025_3371  hypothetical protein  50.98 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.677522  normal  0.937516 
 
 
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NC_011083  SeHA_C1706  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  39.8 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.371341  normal  1 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A1647  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  39.8 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.963071  normal  1 
 
 
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NC_011205  SeD_A1801  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  39.8 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.102221  normal  1 
 
 
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NC_008576  Mmc1_2501  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  37.65 
 
 		 86 aa  50.1  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595307 
 
 
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NC_013159  Svir_08050  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  36.47 
 
 		 90 aa  40  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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