25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3985 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



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Replicon accession
Locus tag
Product
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Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
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Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3985  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  100 
 
 		 100 aa  202  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012560  Avin_50550  hydrogenase assembly chaperone HoxL (HypC/HupF family)  52.48 
 
 		 106 aa  99  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00348713  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7261  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  51.49 
 
 		 102 aa  94.4  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.409873  normal  0.408688 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2025  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  54.55 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.306695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1636  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  46.94 
 
 		 99 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.668575  n/a   
 
 
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NC_011094  SeSA_A1639  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  46.94 
 
 		 99 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007973  Rmet_1292  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  48.65 
 
 		 100 aa  74.7  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000883149  normal  0.714979 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A1647  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  47.96 
 
 		 99 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.963071  normal  1 
 
 
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NC_011083  SeHA_C1706  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  47.96 
 
 		 99 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.371341  normal  1 
 
 
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NC_011205  SeD_A1801  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  47.96 
 
 		 99 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.102221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1159  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  44.33 
 
 		 100 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.16504  n/a   
 
 
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NC_007958  RPD_1167  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  43.43 
 
 		 100 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007925  RPC_3768  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008781  Pnap_1970  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  48 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009720  Xaut_2177  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  43.43 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0242172  normal  0.179012 
 
 
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NC_008825  Mpe_A2821  hypothetical protein  42.67 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_2000  hydrogenase expression/formation  43.3 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.125343  normal  1 
 
 
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NC_007298  Daro_3969  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  41.94 
 
 		 96 aa  60.1  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_1154  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  43.56 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.583061  normal  1 
 
 
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NC_007493  RSP_0500  putative HupF/HypC hydrogenase protein  44.44 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_2151  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  43.43 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.188012  normal  0.193487 
 
 
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NC_007643  Rru_A1165  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  41.67 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.297404  n/a   
 
 
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NC_008576  Mmc1_2501  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  44.26 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595307 
 
 
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NC_008687  Pden_3102  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  44.55 
 
 		 103 aa  50.4  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009429  Rsph17025_3371  hypothetical protein  44 
 
 		 102 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.677522  normal  0.937516 
 
 
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