More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1229 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1229  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 		 306 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.591536 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0776  L-serine ammonia-lyase  97.39 
 
 		 330 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1257  L-serine ammonia-lyase  97.39 
 
 		 330 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.43523  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4400  L-serine ammonia-lyase  91.83 
 
 		 306 aa  495  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1148  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  87.91 
 
 		 306 aa  471  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177832  normal  0.237793 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1136  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  87.58 
 
 		 306 aa  471  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5448  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  58.28 
 
 		 306 aa  345  8e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424863  normal  0.0455036 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0340  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  56.21 
 
 		 306 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2930  L-serine dehydratase, putative  57.53 
 
 		 305 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7663  putative L-serine ammonia-lyase  59.02 
 
 		 354 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2842  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  59.2 
 
 		 305 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.298093 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2128  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  58.86 
 
 		 305 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.173651 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2762  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  58.19 
 
 		 305 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.951768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3899  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  50.84 
 
 		 310 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.492177  normal  0.232429 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4223  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  50.67 
 
 		 310 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.249037 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3585  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  60.07 
 
 		 310 aa  280  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.436718  hitchhiker  0.00950446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4137  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  50.17 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02390  serine family amino acid catabolism-related protein, putative  40.45 
 
 		 331 aa  199  7e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_5354  predicted protein  47.68 
 
 		 313 aa  192  5e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.86415  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3526  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  44.3 
 
 		 305 aa  188  8e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.769029  normal  0.248772 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04217  hypothetical pyridoxal phosphate requiring enzyme (Eurofung)  40.35 
 
 		 360 aa  179  4.999999999999999e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30154  predicted protein  38.49 
 
 		 336 aa  175  9.999999999999999e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.621842  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00180  L-serine ammonia-lyase, putative  32.16 
 
 		 425 aa  161  1e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54974  predicted protein  33.11 
 
 		 355 aa  157  3e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0332644 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6117  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  57.14 
 
 		 198 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.621787  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03866  L-serine dehydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07810)  32.92 
 
 		 444 aa  131  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  33.33 
 
 		 405 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  33.57 
 
 		 403 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0128  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.21 
 
 		 343 aa  122  9e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1660  threonine dehydratase  33.45 
 
 		 403 aa  120  3e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0212485 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  30.1 
 
 		 509 aa  118  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  30.07 
 
 		 401 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  34.13 
 
 		 403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1970  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  35.76 
 
 		 322 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.15703  normal  0.218028 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  34.13 
 
 		 403 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  27.34 
 
 		 402 aa  116  5e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  33.07 
 
 		 403 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  28.36 
 
 		 402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  30.3 
 
 		 514 aa  114  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1638  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.62 
 
 		 322 aa  113  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00191621 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0994  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.78 
 
 		 340 aa  112  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.430606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2084  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  30.18 
 
 		 332 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.432383  normal  0.0544348 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  26.51 
 
 		 501 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2353  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.88 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  26.9 
 
 		 403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6209  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.75 
 
 		 319 aa  109  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0577806 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0227  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.88 
 
 		 353 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  30.48 
 
 		 506 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1872  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.33 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0095677  normal  0.0115658 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  30.48 
 
 		 506 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1558  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.33 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.813791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  26.8 
 
 		 403 aa  108  1e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1431  threonine dehydratase  31.73 
 
 		 509 aa  108  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0729808 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  29.53 
 
 		 403 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5774  threonine dehydratase  35.14 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.154998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  28.89 
 
 		 403 aa  107  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  30.34 
 
 		 501 aa  107  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  31.14 
 
 		 403 aa  106  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  29.08 
 
 		 537 aa  106  5e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1467  threonine dehydratase  32.63 
 
 		 403 aa  106  6e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.912465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0980  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  28.04 
 
 		 326 aa  105  7e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.393122 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  25.78 
 
 		 403 aa  105  7e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6018  threonine dehydratase  35.69 
 
 		 323 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1389  putative threonine dehydratase  29.05 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  27.18 
 
 		 504 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  27.42 
 
 		 514 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  27.18 
 
 		 504 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  27.3 
 
 		 395 aa  104  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  26.07 
 
 		 511 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2085  threonine dehydratase catabolic  36.7 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240523  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5805  threonine dehydratase  34.48 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6169  threonine dehydratase  34.48 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0794807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  30.53 
 
 		 408 aa  103  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6145  threonine dehydratase  33.56 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  30.12 
 
 		 402 aa  103  3e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0449  threonine dehydratase  29.83 
 
 		 507 aa  103  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2234  threonine dehydratase  33.92 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0951  threonine dehydratase  28.28 
 
 		 517 aa  103  5e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0687  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  30.8 
 
 		 304 aa  103  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  28.57 
 
 		 520 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1467  threonine dehydratase  28.28 
 
 		 517 aa  102  6e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0929  threonine dehydratase  31.58 
 
 		 527 aa  102  8e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  25.09 
 
 		 403 aa  102  8e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  25.75 
 
 		 511 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4405  hypothetical protein  28.92 
 
 		 321 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0299  threonine dehydratase  25.68 
 
 		 511 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.380007  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1991  threonine dehydratase catabolic  36.95 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.811048  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1533  threonine dehydratase  33.63 
 
 		 402 aa  101  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.331802  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1494  threonine dehydratase catabolic  36.95 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0428671  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2515  threonine dehydratase catabolic  36.95 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.346313  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  26.12 
 
 		 400 aa  100  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1263  threonine dehydratase catabolic  36.95 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.139617  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3316  threonine dehydratase catabolic  36.95 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0160321  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2406  serine/threonine dehydratase family protein  36.95 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.427217  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2364  serine/threonine dehydratase family protein  35.37 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.688491  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  24.74 
 
 		 403 aa  100  3e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002037  threonine dehydratase biosynthetic  29.89 
 
 		 515 aa  100  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0647  L-threonine ammonia-lyase  32.33 
 
 		 330 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  31.94 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  29.79 
 
 		 526 aa  100  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>