More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1872 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1872  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 		 344 aa  707    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0095677  normal  0.0115658 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2315  putative amino-acid dehydratase  95.35 
 
 		 344 aa  639    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.314922  normal  0.569299 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0994  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  86.73 
 
 		 340 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.430606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3316  threonine dehydratase catabolic  77.08 
 
 		 343 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0160321  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2364  serine/threonine dehydratase family protein  76.79 
 
 		 343 aa  508  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.688491  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1494  threonine dehydratase catabolic  77.08 
 
 		 343 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0428671  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1263  threonine dehydratase catabolic  77.08 
 
 		 343 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.139617  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2515  threonine dehydratase catabolic  77.08 
 
 		 343 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.346313  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2406  serine/threonine dehydratase family protein  77.08 
 
 		 343 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.427217  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1991  threonine dehydratase catabolic  77.08 
 
 		 343 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.811048  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2085  threonine dehydratase catabolic  75.22 
 
 		 343 aa  503  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240523  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5257  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  76.49 
 
 		 339 aa  487  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.000000000036392  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1970  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  76.19 
 
 		 339 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.297392  normal  0.0488964 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1861  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  76.79 
 
 		 339 aa  487  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111511  hitchhiker  0.0000555512 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6133  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  76.19 
 
 		 339 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0492571  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1934  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  76.79 
 
 		 351 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.0000000179366  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1946  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  76.19 
 
 		 339 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0512666  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1325  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  76.56 
 
 		 339 aa  472  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000000000130693  hitchhiker  0.00142228 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0497  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  55.9 
 
 		 339 aa  300  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.492672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1588  L-threonine ammonia-lyase  52.1 
 
 		 291 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0888  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.99 
 
 		 324 aa  187  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.520177 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2700  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  35.71 
 
 		 321 aa  186  6e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4888  putative threonine dehydratase, catabolic  34.74 
 
 		 325 aa  184  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2376  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.01 
 
 		 317 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.954414  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  36.71 
 
 		 403 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  36.83 
 
 		 320 aa  183  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6209  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.81 
 
 		 319 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0577806 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3309  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  36.04 
 
 		 319 aa  182  6e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0279719  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  36.14 
 
 		 405 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3920  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  34.74 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.903955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2603  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  33.44 
 
 		 320 aa  178  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000516286  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  37.03 
 
 		 403 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  32.28 
 
 		 403 aa  176  6e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  36.71 
 
 		 403 aa  176  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  31.97 
 
 		 402 aa  176  6e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1389  putative threonine dehydratase  33.54 
 
 		 326 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0687  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  40.06 
 
 		 304 aa  175  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0980  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  32.59 
 
 		 326 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.393122 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4366  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  34.42 
 
 		 315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  31.35 
 
 		 402 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2353  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.84 
 
 		 304 aa  170  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0227  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.48 
 
 		 353 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  35.13 
 
 		 403 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1010  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.55 
 
 		 315 aa  165  8e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.929985 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  34.48 
 
 		 403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  30.82 
 
 		 403 aa  164  3e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4177  serine/threonine dehydratase  35.56 
 
 		 326 aa  163  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  30.38 
 
 		 403 aa  162  6e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1698  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.14 
 
 		 328 aa  161  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2922  threonine dehydratase  38.06 
 
 		 313 aa  160  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  31.93 
 
 		 403 aa  160  2e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  32.46 
 
 		 400 aa  160  2e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  32.91 
 
 		 401 aa  161  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  30.16 
 
 		 403 aa  160  3e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  36.09 
 
 		 403 aa  160  4e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1970  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  37.22 
 
 		 322 aa  159  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.15703  normal  0.218028 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3215  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  36.51 
 
 		 324 aa  159  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  35.56 
 
 		 403 aa  159  9e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1524  serine/threonine dehydratase  34.63 
 
 		 327 aa  158  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00616628  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  29.84 
 
 		 403 aa  158  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  34.56 
 
 		 402 aa  157  2e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2024  serine/threonine dehydratase  34.3 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  29.84 
 
 		 403 aa  157  2e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2154  serine/threonine dehydratase  34.3 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160639  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3108  serine/threonine dehydratase  34.3 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3078  serine/threonine dehydratase  34.3 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.642158  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2589  serine/threonine dehydratase  34.3 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0755  serine/threonine dehydratase  34.3 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.284278  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3024  serine/threonine dehydratase  34.3 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.657455  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5857  serine/threonine dehydratase  35.76 
 
 		 324 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  33.33 
 
 		 504 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  33.33 
 
 		 504 aa  156  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4343  serine/threonine dehydratase  35.33 
 
 		 324 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3882  serine/threonine dehydratase  35.33 
 
 		 324 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0375891 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1493  serine/threonine dehydratase  34.81 
 
 		 324 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.317282 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4405  hypothetical protein  31.54 
 
 		 321 aa  155  9e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4935  threonine dehydratase  32.61 
 
 		 403 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3918  serine/threonine dehydratase  35.44 
 
 		 324 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4450  serine/threonine dehydratase  35.44 
 
 		 324 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2250  serine/threonine dehydratase  34.18 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.63083  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1447  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  35.98 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0170532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4359  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.56 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2122  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.54 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113848  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  32.62 
 
 		 402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2084  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  32.56 
 
 		 332 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.432383  normal  0.0544348 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  33.02 
 
 		 514 aa  153  4e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  34.83 
 
 		 520 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0534  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  36.05 
 
 		 321 aa  152  5.9999999999999996e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1722  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.7 
 
 		 320 aa  152  5.9999999999999996e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0996  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.54 
 
 		 338 aa  152  7e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  33.45 
 
 		 402 aa  152  8e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2636  threonine dehydratase  37.06 
 
 		 402 aa  152  8.999999999999999e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  33.33 
 
 		 403 aa  152  8.999999999999999e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3470  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.03 
 
 		 318 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.380484  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  36.8 
 
 		 506 aa  151  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0152  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.86 
 
 		 318 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2234  threonine dehydratase  35.81 
 
 		 308 aa  151  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  36.8 
 
 		 506 aa  151  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4113  serine/threonine dehydratase  36.19 
 
 		 325 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.559381  normal  0.528842 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4000  serine/threonine dehydratase  36.19 
 
 		 325 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>