61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_2580 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_2580  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
39 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0100504  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  97.44 
 
 
269 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  97.44 
 
 
269 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  94.87 
 
 
269 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  94.87 
 
 
269 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403249  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  94.87 
 
 
269 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  94.87 
 
 
269 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  94.87 
 
 
269 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2630  transcriptional regulator, MerR family  92.31 
 
 
269 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00281071  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  82.05 
 
 
270 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  58.97 
 
 
276 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0247  MerR family transcriptional regulator  58.97 
 
 
287 aa  57.4  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  61.54 
 
 
272 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4044  transcriptional regulator, MerR family  53.85 
 
 
271 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3830  transcriptional regulator, MerR family  61.54 
 
 
274 aa  55.1  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0425  MerR family transcriptional regulator  53.85 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321126  normal  0.815952 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2598  transcriptional regulator, MerR family  56.41 
 
 
271 aa  53.5  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000630559  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2992  transcriptional regulator, MerR family  53.85 
 
 
282 aa  53.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.663692  normal  0.0173107 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  53.85 
 
 
286 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  56.41 
 
 
272 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  56.41 
 
 
269 aa  52.4  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03030  predicted transcriptional regulator  58.33 
 
 
276 aa  51.2  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  53.85 
 
 
264 aa  50.8  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2808  transcriptional regulator, MerR family  55.56 
 
 
276 aa  50.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal  0.316047 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2638  transcriptional regulator, MerR family  58.97 
 
 
273 aa  48.9  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3205  MerR family transcriptional regulator  48.72 
 
 
273 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.208736  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2481  transcriptional regulator, MerR family  48.72 
 
 
269 aa  48.1  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.564945  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  48.72 
 
 
289 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22860  predicted transcriptional regulator  53.85 
 
 
224 aa  48.1  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2528  transcriptional regulator, MerR family  46.15 
 
 
293 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3493  transcriptional regulator, MerR family  48.72 
 
 
273 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  48.72 
 
 
258 aa  47.8  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  48.72 
 
 
262 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3503  transcriptional regulator, putative  48.72 
 
 
273 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590051  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2529  transcriptional regulator, MerR family  46.15 
 
 
270 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  44.74 
 
 
274 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2263  transcriptional regulator, MerR family  51.28 
 
 
281 aa  45.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1993  transcriptional regulator, MerR family  48.72 
 
 
272 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0455  MerR family transcriptional regulator  52.63 
 
 
261 aa  44.7  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00278493  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0010  hypothetical protein  51.52 
 
 
270 aa  44.7  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0445  MerR family transcriptional regulator  52.63 
 
 
261 aa  45.1  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0194713  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  48.72 
 
 
249 aa  44.7  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  51.28 
 
 
274 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0932  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
290 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1458  MerR family transcriptional regulator  47.37 
 
 
161 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168574  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4163  transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 
275 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 
270 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3304  MCP methyltransferase, CheR-type  52.63 
 
 
398 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  43.59 
 
 
267 aa  43.5  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0226  transcriptional regulator, MerR family  47.37 
 
 
276 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814651  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5383  transcriptional regulator, MerR family  46.15 
 
 
266 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.94507 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4623  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 
297 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22770  predicted transcriptional regulator  46.15 
 
 
284 aa  42.4  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  46.15 
 
 
369 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8866  putative transcriptional regulator, MerR family  43.59 
 
 
279 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.249264  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  46.15 
 
 
274 aa  41.2  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1657  transcriptional regulator, MerR family  39.47 
 
 
272 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
276 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1701  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
280 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126124  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2419  protein serine/threonine phosphatase  43.59 
 
 
355 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1424  MerR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
279 aa  40.4  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.140644 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>