33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9202 on replicon NC_011984
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011984  Avi_9202  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  468  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6752  hypothetical protein  45.66 
 
 		 218 aa  158  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.607582 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2768  hypothetical protein  48.8 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2428  hypothetical protein  49.28 
 
 		 260 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4733  hypothetical protein  36.57 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2342  hypothetical protein  37.13 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5297  hypothetical protein  32.37 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.698895  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2467  hypothetical protein  36.45 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430704 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0128  hypothetical protein  33.63 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05661  hypothetical protein  33.33 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6847  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.54 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2968  hypothetical protein  35.11 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.491451  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1038  Asp/Glu racemase  34.92 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2913  hypothetical protein  23.22 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.719661  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3581  Asp/Glu racemase  36.81 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.278765  normal  0.265944 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3133  hypothetical protein  23.22 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0662  hypothetical protein  36.02 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.123664  normal  0.120506 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1915  hypothetical protein  40.19 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.644211  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1505  hypothetical protein  29.36 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0449573  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2075  hypothetical protein  42.86 
 
 		 135 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.26893  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3408  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.82 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000155733 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2141  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.7 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.594037  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1556  Asp/Glu racemase  27.98 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.530998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1928  hypothetical protein  40 
 
 		 80 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0328337  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3133  hypothetical protein  20.85 
 
 		 226 aa  52  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0604342  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0436  Asp/Glu racemase  29.63 
 
 		 219 aa  48.9  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.639222  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2487  Asp/Glu racemase  31.82 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2745  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.59 
 
 		 220 aa  46.2  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2801  Asp/Glu racemase  28.43 
 
 		 218 aa  45.8  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.493832  normal  0.510062 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3600  Asp/Glu racemase  30.1 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374024  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2735  hypothetical protein  21.54 
 
 		 218 aa  41.6  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000016987  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0298  hypothetical protein  54.05 
 
 		 119 aa  41.6  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.191638  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1635  alanine racemase  54.05 
 
 		 119 aa  41.6  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0334614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>