17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3408 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3408  Asp/Glu/hydantoin racemase  100 
 
 		 223 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000155733 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1038  Asp/Glu racemase  42.33 
 
 		 227 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2801  Asp/Glu racemase  44.6 
 
 		 218 aa  148  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.493832  normal  0.510062 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3600  Asp/Glu racemase  44.19 
 
 		 218 aa  136  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374024  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2517  Asp/Glu racemase  52.04 
 
 		 116 aa  95.5  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.438751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5297  hypothetical protein  28.77 
 
 		 232 aa  92.8  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.698895  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1556  Asp/Glu racemase  33.49 
 
 		 218 aa  92.4  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.530998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6847  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.49 
 
 		 219 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0436  Asp/Glu racemase  25.59 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.639222  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3581  Asp/Glu racemase  26.01 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.278765  normal  0.265944 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2141  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.57 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.594037  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2745  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.65 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2487  Asp/Glu racemase  31.11 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9202  hypothetical protein  32.82 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2342  hypothetical protein  21.13 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1505  hypothetical protein  28.19 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0449573  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05661  hypothetical protein  30.41 
 
 		 195 aa  41.6  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>