16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2342 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2342  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  427  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2968  hypothetical protein  39.81 
 
 		 225 aa  131  9e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.491451  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1505  hypothetical protein  35.68 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0449573  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0128  hypothetical protein  35.27 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2141  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.96 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.594037  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05661  hypothetical protein  38.74 
 
 		 195 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6847  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.46 
 
 		 219 aa  104  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9202  hypothetical protein  37.13 
 
 		 231 aa  104  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2467  hypothetical protein  36.79 
 
 		 227 aa  102  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430704 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2745  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.87 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3581  Asp/Glu racemase  33.8 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.278765  normal  0.265944 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5297  hypothetical protein  33.17 
 
 		 232 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.698895  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0436  Asp/Glu racemase  31.73 
 
 		 219 aa  87.4  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.639222  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2428  hypothetical protein  30.94 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3408  Asp/Glu/hydantoin racemase  21.13 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000155733 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6752  hypothetical protein  28.23 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.607582 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>