23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5297 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5297  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  471  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.698895  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2141  Asp/Glu/hydantoin racemase  49.02 
 
 		 222 aa  179  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.594037  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2745  Asp/Glu/hydantoin racemase  46.7 
 
 		 220 aa  170  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3581  Asp/Glu racemase  43.46 
 
 		 222 aa  159  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.278765  normal  0.265944 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0436  Asp/Glu racemase  37.67 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.639222  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6847  Asp/Glu/hydantoin racemase  36.32 
 
 		 219 aa  136  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2342  hypothetical protein  33.17 
 
 		 212 aa  97.1  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3408  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.77 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000155733 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1038  Asp/Glu racemase  33.04 
 
 		 227 aa  89.4  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0128  hypothetical protein  31.33 
 
 		 230 aa  85.5  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9202  hypothetical protein  32.37 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1505  hypothetical protein  33.02 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0449573  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05661  hypothetical protein  32.26 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2467  hypothetical protein  31.46 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430704 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3600  Asp/Glu racemase  31.58 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374024  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1556  Asp/Glu racemase  28.77 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.530998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2968  hypothetical protein  30.43 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.491451  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2801  Asp/Glu racemase  28.96 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.493832  normal  0.510062 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2487  Asp/Glu racemase  32.06 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6752  hypothetical protein  30.22 
 
 		 218 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.607582 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2428  hypothetical protein  35.17 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2735  hypothetical protein  22.52 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000016987  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4733  hypothetical protein  31.48 
 
 		 215 aa  42  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>