14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3600 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3600  Asp/Glu racemase  100 
 
 		 218 aa  433  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374024  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2801  Asp/Glu racemase  83.02 
 
 		 218 aa  331  6e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.493832  normal  0.510062 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1038  Asp/Glu racemase  66.04 
 
 		 227 aa  266  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2517  Asp/Glu racemase  84.85 
 
 		 116 aa  155  4e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.438751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3408  Asp/Glu/hydantoin racemase  44.19 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000155733 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1556  Asp/Glu racemase  34.84 
 
 		 218 aa  93.6  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.530998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6847  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.18 
 
 		 219 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5297  hypothetical protein  31.58 
 
 		 232 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.698895  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2141  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.94 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.594037  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0436  Asp/Glu racemase  29.49 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.639222  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2487  Asp/Glu racemase  34.71 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3581  Asp/Glu racemase  25.7 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.278765  normal  0.265944 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2745  Asp/Glu/hydantoin racemase  30.05 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9202  hypothetical protein  30.65 
 
 		 231 aa  48.9  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>