18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1038 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1038  Asp/Glu racemase  100 
 
 		 227 aa  455  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2801  Asp/Glu racemase  66.36 
 
 		 218 aa  259  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.493832  normal  0.510062 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3600  Asp/Glu racemase  66.04 
 
 		 218 aa  248  6e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374024  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3408  Asp/Glu/hydantoin racemase  42.33 
 
 		 223 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000155733 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2517  Asp/Glu racemase  72.45 
 
 		 116 aa  124  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.438751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6847  Asp/Glu/hydantoin racemase  37.56 
 
 		 219 aa  112  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2141  Asp/Glu/hydantoin racemase  36.2 
 
 		 222 aa  99  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.594037  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1556  Asp/Glu racemase  34.67 
 
 		 218 aa  89.7  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.530998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5297  hypothetical protein  33.04 
 
 		 232 aa  89.4  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.698895  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0436  Asp/Glu racemase  32.38 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.639222  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3581  Asp/Glu racemase  29.36 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.278765  normal  0.265944 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9202  hypothetical protein  34.92 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2745  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.8 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2487  Asp/Glu racemase  35.29 
 
 		 241 aa  53.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3133  hypothetical protein  19.55 
 
 		 227 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2913  hypothetical protein  19.55 
 
 		 227 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.719661  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3133  hypothetical protein  19.18 
 
 		 226 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0604342  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05661  hypothetical protein  31.85 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>