9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2517 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2517  Asp/Glu racemase  100 
 
 		 116 aa  234  4e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.438751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3600  Asp/Glu racemase  84.85 
 
 		 218 aa  176  7e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374024  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2801  Asp/Glu racemase  82.83 
 
 		 218 aa  172  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.493832  normal  0.510062 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1038  Asp/Glu racemase  72.45 
 
 		 227 aa  147  6e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3408  Asp/Glu/hydantoin racemase  52.04 
 
 		 223 aa  101  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000155733 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1556  Asp/Glu racemase  45.92 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.530998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2487  Asp/Glu racemase  41 
 
 		 241 aa  60.8  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5297  hypothetical protein  30.53 
 
 		 232 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.698895  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6847  Asp/Glu/hydantoin racemase  29 
 
 		 219 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>