25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6847 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6847  Asp/Glu/hydantoin racemase  100 
 
 		 219 aa  434  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0436  Asp/Glu racemase  60.37 
 
 		 219 aa  254  8e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.639222  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2141  Asp/Glu/hydantoin racemase  43.58 
 
 		 222 aa  171  5e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.594037  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3581  Asp/Glu racemase  43.06 
 
 		 222 aa  165  5e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.278765  normal  0.265944 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2745  Asp/Glu/hydantoin racemase  41.67 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5297  hypothetical protein  36.32 
 
 		 232 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.698895  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1038  Asp/Glu racemase  37.56 
 
 		 227 aa  112  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2342  hypothetical protein  31.46 
 
 		 212 aa  104  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2968  hypothetical protein  33.5 
 
 		 225 aa  98.6  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.491451  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3408  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.49 
 
 		 223 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000155733 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1505  hypothetical protein  29.17 
 
 		 231 aa  85.9  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0449573  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2801  Asp/Glu racemase  33.18 
 
 		 218 aa  81.6  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.493832  normal  0.510062 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05661  hypothetical protein  31.16 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3600  Asp/Glu racemase  33.18 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374024  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9202  hypothetical protein  32.54 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2467  hypothetical protein  30.05 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430704 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1556  Asp/Glu racemase  27.1 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.530998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2487  Asp/Glu racemase  27.72 
 
 		 241 aa  58.2  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0128  hypothetical protein  23.61 
 
 		 230 aa  48.9  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2428  hypothetical protein  33.55 
 
 		 260 aa  48.1  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2735  hypothetical protein  21.93 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000016987  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3133  hypothetical protein  24.79 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2913  hypothetical protein  24.79 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.719661  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1360  glutamate racemase  27.45 
 
 		 269 aa  42  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1467  glutamate racemase  25.27 
 
 		 292 aa  41.6  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0107271  normal  0.23474 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>