23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2428 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I2428  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9202  hypothetical protein  49.76 
 
 
231 aa  173  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6752  hypothetical protein  47.83 
 
 
218 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.607582 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2768  hypothetical protein  47.83 
 
 
246 aa  125  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1915  hypothetical protein  79.25 
 
 
106 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.644211  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2075  hypothetical protein  79.31 
 
 
135 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.26893  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1928  hypothetical protein  82.5 
 
 
80 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0328337  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4733  hypothetical protein  44.32 
 
 
215 aa  106  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2342  hypothetical protein  32.11 
 
 
212 aa  83.2  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0662  hypothetical protein  44.51 
 
 
175 aa  81.6  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.123664  normal  0.120506 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1635  alanine racemase  77.46 
 
 
119 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0334614  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0298  hypothetical protein  77.46 
 
 
119 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.191638  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05661  hypothetical protein  29.89 
 
 
195 aa  76.3  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5297  hypothetical protein  36.3 
 
 
232 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.698895  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6847  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.55 
 
 
219 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2968  hypothetical protein  36.64 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.491451  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1505  hypothetical protein  38.26 
 
 
231 aa  64.7  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0449573  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2467  hypothetical protein  38.25 
 
 
227 aa  60.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.430704 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2141  Asp/Glu/hydantoin racemase  30.26 
 
 
222 aa  59.7  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.594037  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0128  hypothetical protein  28.99 
 
 
230 aa  58.5  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3581  Asp/Glu racemase  30.04 
 
 
222 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.278765  normal  0.265944 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3408  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.33 
 
 
223 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000155733 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2745  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.64 
 
 
220 aa  43.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>