16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05661 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05661  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  396  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2968  hypothetical protein  40.72 
 
 		 225 aa  108  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.491451  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2342  hypothetical protein  38.74 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0128  hypothetical protein  28.36 
 
 		 230 aa  91.3  8e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6847  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.16 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1505  hypothetical protein  33.33 
 
 		 231 aa  77.8  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0449573  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5297  hypothetical protein  32.26 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.698895  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9202  hypothetical protein  33.33 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0436  Asp/Glu racemase  28.86 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.639222  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2141  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.46 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.594037  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2745  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.64 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2467  hypothetical protein  32.73 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430704 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2428  hypothetical protein  29.73 
 
 		 260 aa  52.8  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3581  Asp/Glu racemase  32.87 
 
 		 222 aa  48.5  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.278765  normal  0.265944 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1038  Asp/Glu racemase  31.85 
 
 		 227 aa  43.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3408  Asp/Glu/hydantoin racemase  30.41 
 
 		 223 aa  41.6  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000155733 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>