23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0436 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0436  Asp/Glu racemase  100 
 
 		 219 aa  434  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.639222  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6847  Asp/Glu/hydantoin racemase  60.37 
 
 		 219 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2141  Asp/Glu/hydantoin racemase  46.19 
 
 		 222 aa  176  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.594037  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2745  Asp/Glu/hydantoin racemase  40.85 
 
 		 220 aa  152  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3581  Asp/Glu racemase  39.55 
 
 		 222 aa  152  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.278765  normal  0.265944 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5297  hypothetical protein  37.67 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.698895  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1038  Asp/Glu racemase  32.86 
 
 		 227 aa  90.5  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3408  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.59 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000155733 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2342  hypothetical protein  32.21 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2968  hypothetical protein  30.24 
 
 		 225 aa  88.2  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.491451  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1505  hypothetical protein  29.25 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0449573  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05661  hypothetical protein  28.86 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2801  Asp/Glu racemase  29.6 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.493832  normal  0.510062 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3600  Asp/Glu racemase  29.95 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374024  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2467  hypothetical protein  30.92 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430704 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1556  Asp/Glu racemase  27.6 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.530998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2487  Asp/Glu racemase  26.73 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9202  hypothetical protein  29.63 
 
 		 231 aa  49.3  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3133  hypothetical protein  25.31 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0604342  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3133  hypothetical protein  23.46 
 
 		 227 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2913  hypothetical protein  23.46 
 
 		 227 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.719661  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2735  hypothetical protein  27.27 
 
 		 218 aa  45.1  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000016987  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0128  hypothetical protein  24.77 
 
 		 230 aa  45.1  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.746604 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>