18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2487 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2487  Asp/Glu racemase  100 
 
 		 241 aa  461  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1556  Asp/Glu racemase  47.06 
 
 		 218 aa  165  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.530998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3408  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.11 
 
 		 223 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000155733 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6847  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.03 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0436  Asp/Glu racemase  28.91 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.639222  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2801  Asp/Glu racemase  35.34 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.493832  normal  0.510062 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3600  Asp/Glu racemase  34.71 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374024  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5297  hypothetical protein  28.38 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.698895  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3581  Asp/Glu racemase  27.98 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.278765  normal  0.265944 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2517  Asp/Glu racemase  41 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.438751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1038  Asp/Glu racemase  35.29 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2141  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.5 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.594037  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2745  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.89 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9202  hypothetical protein  31.76 
 
 		 231 aa  52  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3133  hypothetical protein  19.21 
 
 		 227 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2913  hypothetical protein  19.21 
 
 		 227 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.719661  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6752  hypothetical protein  34.66 
 
 		 218 aa  45.8  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.607582 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3133  hypothetical protein  19.23 
 
 		 226 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0604342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>