18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6752 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6752  hypothetical protein  100 
 
 
218 aa  432  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.607582 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2768  hypothetical protein  79.15 
 
 
246 aa  294  8e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9202  hypothetical protein  45.66 
 
 
231 aa  166  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4733  hypothetical protein  42.31 
 
 
215 aa  126  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2428  hypothetical protein  47.83 
 
 
260 aa  99.8  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0662  hypothetical protein  44.2 
 
 
175 aa  70.5  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.123664  normal  0.120506 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0128  hypothetical protein  26.41 
 
 
230 aa  63.2  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5297  hypothetical protein  30.22 
 
 
232 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.698895  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2075  hypothetical protein  47.14 
 
 
135 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.26893  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3581  Asp/Glu racemase  28.51 
 
 
222 aa  54.3  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.278765  normal  0.265944 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1915  hypothetical protein  45.12 
 
 
106 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.644211  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1505  hypothetical protein  30.91 
 
 
231 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0449573  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2342  hypothetical protein  28.23 
 
 
212 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2467  hypothetical protein  32.05 
 
 
227 aa  53.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.430704 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1928  hypothetical protein  48.39 
 
 
80 aa  51.6  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0328337  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2487  Asp/Glu racemase  34.66 
 
 
241 aa  48.9  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6847  Asp/Glu/hydantoin racemase  26.92 
 
 
219 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3408  Asp/Glu/hydantoin racemase  30.26 
 
 
223 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000155733 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>