15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2768 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2768  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6752  hypothetical protein  78.6 
 
 
218 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.607582 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9202  hypothetical protein  47.09 
 
 
231 aa  176  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4733  hypothetical protein  40.09 
 
 
215 aa  116  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2428  hypothetical protein  47.83 
 
 
260 aa  96.7  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2075  hypothetical protein  52.31 
 
 
135 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.26893  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0128  hypothetical protein  25.88 
 
 
230 aa  63.2  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0662  hypothetical protein  39.47 
 
 
175 aa  62  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.123664  normal  0.120506 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1915  hypothetical protein  47.56 
 
 
106 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.644211  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1928  hypothetical protein  50.82 
 
 
80 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0328337  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1505  hypothetical protein  29.41 
 
 
231 aa  55.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0449573  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2467  hypothetical protein  30.9 
 
 
227 aa  54.7  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.430704 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5297  hypothetical protein  31.37 
 
 
232 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.698895  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2487  Asp/Glu racemase  33 
 
 
241 aa  42.4  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1556  Asp/Glu racemase  28.42 
 
 
218 aa  42  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.530998  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>