17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1505 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1505  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  443  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0449573  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2342  hypothetical protein  35.68 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2968  hypothetical protein  38.54 
 
 		 225 aa  102  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.491451  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6847  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.17 
 
 		 219 aa  85.9  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2141  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.75 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.594037  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2467  hypothetical protein  37.44 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430704 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3581  Asp/Glu racemase  32.89 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.278765  normal  0.265944 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0128  hypothetical protein  27.23 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2745  Asp/Glu/hydantoin racemase  30.59 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05661  hypothetical protein  33.33 
 
 		 195 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5297  hypothetical protein  33.02 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.698895  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0436  Asp/Glu racemase  29.25 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.639222  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9202  hypothetical protein  29.36 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3408  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.19 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000155733 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6752  hypothetical protein  29.58 
 
 		 218 aa  45.8  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.607582 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2428  hypothetical protein  38.26 
 
 		 260 aa  45.4  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2768  hypothetical protein  29.41 
 
 		 246 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>