29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3581 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3581  Asp/Glu racemase  100 
 
 		 222 aa  441  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.278765  normal  0.265944 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2141  Asp/Glu/hydantoin racemase  41.67 
 
 		 222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.594037  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6847  Asp/Glu/hydantoin racemase  43.06 
 
 		 219 aa  165  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5297  hypothetical protein  43.46 
 
 		 232 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.698895  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2745  Asp/Glu/hydantoin racemase  39.81 
 
 		 220 aa  156  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0436  Asp/Glu racemase  39.55 
 
 		 219 aa  145  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.639222  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2342  hypothetical protein  33.8 
 
 		 212 aa  97.8  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2467  hypothetical protein  34.72 
 
 		 227 aa  85.1  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430704 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1505  hypothetical protein  32.89 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0449573  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3408  Asp/Glu/hydantoin racemase  26.01 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000155733 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2968  hypothetical protein  33.33 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.491451  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1038  Asp/Glu racemase  29.36 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0128  hypothetical protein  29.31 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9202  hypothetical protein  36.81 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2801  Asp/Glu racemase  26.79 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.493832  normal  0.510062 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1297  Asp/Glu/hydantoin racemase  30.95 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0750406  normal  0.408598 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2487  Asp/Glu racemase  27.98 
 
 		 241 aa  50.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05661  hypothetical protein  32.87 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3770  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.4 
 
 		 253 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6752  hypothetical protein  28.51 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.607582 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2735  hypothetical protein  21.28 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000016987  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3600  Asp/Glu racemase  27.27 
 
 		 218 aa  45.8  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374024  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0588  glutamate racemase  28.21 
 
 		 281 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3133  hypothetical protein  19.55 
 
 		 227 aa  45.8  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2913  hypothetical protein  19.55 
 
 		 227 aa  45.8  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.719661  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0603  glutamate racemase  28.21 
 
 		 281 aa  45.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0094  Asp/Glu racemase  34.94 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1467  glutamate racemase  34.74 
 
 		 292 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0107271  normal  0.23474 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0161  glutamate racemase  32.84 
 
 		 270 aa  41.6  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0534068  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>