123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3770 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3770  Asp/Glu/hydantoin racemase  100 
 
 
253 aa  499  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0933  Asp/Glu racemase  56.6 
 
 
234 aa  261  6e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1813  Asp/Glu/hydantoin racemase  55.97 
 
 
245 aa  248  6e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1297  Asp/Glu/hydantoin racemase  53.91 
 
 
244 aa  246  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0750406  normal  0.408598 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1097  Asp/Glu racemase  54.55 
 
 
261 aa  246  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3936  Asp/Glu/hydantoin racemase  53.72 
 
 
245 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1879  Asp/Glu/hydantoin racemase  53.72 
 
 
278 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53096  normal  0.236918 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5279  Asp/Glu racemase  53.47 
 
 
263 aa  232  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0404858 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6113  Asp/Glu racemase  53.47 
 
 
263 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1964  Asp/Glu racemase  53.47 
 
 
263 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1301  Asp/Glu/hydantoin racemase  51.65 
 
 
285 aa  231  9e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1306  Asp/Glu/hydantoin racemase  52.65 
 
 
278 aa  230  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.612078  normal  0.031069 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1988  Asp/Glu/hydantoin racemase  53.01 
 
 
263 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.557931 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2330  Asp/Glu/hydantoin racemase  52.26 
 
 
288 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.496574 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1952  Asp/Glu racemase  53.72 
 
 
279 aa  229  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2066  racemase  52.89 
 
 
287 aa  228  6e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1925  putative hydantoin racemase  51.24 
 
 
288 aa  226  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1509  hydantoin racemase  52.07 
 
 
280 aa  225  6e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.722971  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2008  hydantoin racemase  52.07 
 
 
280 aa  225  6e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3302  hydantoin racemase  52.07 
 
 
280 aa  225  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2389  hydantoin racemase  52.07 
 
 
280 aa  225  7e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2534  racemase  52.07 
 
 
327 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0701963  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2433  hydantoin racemase  52.07 
 
 
318 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0332  Asp/Glu racemase  51.48 
 
 
238 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0658  Asp/Glu/hydantoin racemase  47.92 
 
 
245 aa  210  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.184482  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0210  Asp/Glu/hydantoin racemase  50.2 
 
 
247 aa  204  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0948145 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1874  hydantoin racemase  45.49 
 
 
243 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.139433  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0868  Asp/Glu/hydantoin racemase  48.95 
 
 
245 aa  199  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.642238  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3529  Asp/Glu racemase  45.08 
 
 
243 aa  199  5e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3130  Asp/Glu racemase  47.11 
 
 
243 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000715439 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3376  hydantoin racemase  47.92 
 
 
243 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.732372 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0470  Asp/Glu racemase  40.91 
 
 
243 aa  194  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0915  Asp/Glu racemase  47.92 
 
 
247 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0900  Asp/Glu/hydantoin racemase  47.5 
 
 
244 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.022197  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0077  Asp/Glu racemase  45.08 
 
 
243 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.45629  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2916  Asp/Glu/hydantoin racemase  45.82 
 
 
247 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.492378  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3768  putative hydantoin-racemase  47.01 
 
 
247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2655  Asp/Glu/hydantoin racemase  44.86 
 
 
247 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0679  Asp/Glu racemase  43.64 
 
 
236 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0768431  normal  0.106443 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1759  hydantoin racemase  51.37 
 
 
205 aa  170  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4419  Asp/Glu racemase  40.82 
 
 
243 aa  170  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.192959  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6274  hydantoin Racemase  45.68 
 
 
258 aa  169  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0404  Asp/Glu racemase  40.77 
 
 
232 aa  167  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000866633  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5785  Asp/Glu racemase  42.25 
 
 
241 aa  156  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415529  hitchhiker  0.00131329 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1006  Asp/Glu racemase  44.8 
 
 
220 aa  154  9e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.832843  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1023  Asp/Glu racemase  44.8 
 
 
220 aa  154  9e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.493832  normal  0.560856 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1033  Asp/Glu racemase  44.8 
 
 
220 aa  154  9e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.026155  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3637  Asp/Glu/hydantoin racemase  35.39 
 
 
242 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3876  Asp/Glu/hydantoin racemase  35.39 
 
 
242 aa  141  9e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4310  hydantoin racemase, putative  35.8 
 
 
242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1557  Asp/Glu racemase  35.8 
 
 
242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3171  Asp/Glu racemase  36.02 
 
 
240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.560944  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2028  Asp/Glu/hydantoin racemase  37.29 
 
 
240 aa  138  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1755  Asp/Glu racemase  34.16 
 
 
242 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3412  Asp/Glu racemase  36.4 
 
 
247 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3193  Asp/Glu/hydantoin racemase  36.55 
 
 
252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4993  Asp/Glu/hydantoin racemase  35.22 
 
 
250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.561877  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0738  putative hydantoin racemase  34.58 
 
 
254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.304234  normal  0.968812 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0094  Asp/Glu racemase  35.44 
 
 
239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2040  Asp/Glu racemase  34.98 
 
 
242 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00180989  normal  0.15081 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4855  Asp/Glu racemase  36.44 
 
 
258 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.456805 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4337  Asp/Glu racemase  35.17 
 
 
240 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.573919  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4029  Asp/Glu racemase  35.17 
 
 
240 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.016763  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3495  Asp/Glu/hydantoin racemase  35.17 
 
 
240 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.714298  hitchhiker  0.00106487 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7936  Asp/Glu/hydantoin racemase  35.59 
 
 
256 aa  122  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0552  Asp/Glu racemase  33.88 
 
 
248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.886079  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7191  putative Hydantoin racemase  32.49 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425956  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4276  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.41 
 
 
251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4136  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.78 
 
 
245 aa  109  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29444  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4023  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.78 
 
 
245 aa  109  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3885  putative Asp/Glu racemase  33.06 
 
 
245 aa  108  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0044  Asp/Glu racemase  31.78 
 
 
245 aa  106  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.399037  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4065  Asp/Glu racemase  32.68 
 
 
279 aa  106  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4060  Asp/Glu racemase  40.1 
 
 
218 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0300  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.51 
 
 
248 aa  101  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3633  hypothetical protein  39.6 
 
 
220 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08417  conserved hypothetical protein  34.67 
 
 
627 aa  99  7e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1251  Asp/Glu/hydantoin racemase  38.21 
 
 
250 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3334  HyuE hydantoin racemase  39.43 
 
 
205 aa  95.5  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1486  Asp/Glu racemase  30.62 
 
 
229 aa  95.5  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.293318  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5804  Asp/Glu/hydantoin racemase  37 
 
 
226 aa  92  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.372709  normal  0.802095 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2107  putative Hydantoin racemase HyuA  30.88 
 
 
212 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3797  Asp/Glu racemase  33.18 
 
 
227 aa  89.7  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.175328  normal  0.366976 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5846  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.37 
 
 
249 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.963057  hitchhiker  0.000744144 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0467  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.32 
 
 
250 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5610  Asp/Glu/hydantoin racemase  30.57 
 
 
247 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2076  Asp/Glu/hydantoin racemase  31 
 
 
245 aa  86.3  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.491688 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3273  Asp/Glu racemase  33.96 
 
 
251 aa  79.7  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.325881  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3382  hydantoin racemase  28.51 
 
 
229 aa  79.3  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2261  racemase, putative  29.87 
 
 
238 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.113318  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4026  hydantoin racemase  22.83 
 
 
266 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.997842 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3463  putative hydantoin racemase  32.52 
 
 
213 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1006  Asp/Glu racemase  33.81 
 
 
246 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.719563  hitchhiker  0.00113636 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2468  Asp/Glu racemase  33.64 
 
 
250 aa  73.6  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3108  Asp/Glu racemase  32.52 
 
 
213 aa  73.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0539324  normal  0.209365 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2068  Asp/Glu racemase  32.52 
 
 
213 aa  72  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.2159 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5283  Asp/Glu/hydantoin racemase  42.11 
 
 
241 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.203611 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1556  Asp/Glu racemase  35.71 
 
 
267 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0955  hydantoin racemase  31.19 
 
 
231 aa  70.5  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0677  putative hydantoin racemase protein  28.29 
 
 
253 aa  68.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0966453  normal  0.11063 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>