24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2745 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2745  Asp/Glu/hydantoin racemase  100 
 
 		 220 aa  439  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2141  Asp/Glu/hydantoin racemase  72.73 
 
 		 222 aa  325  5e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.594037  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5297  hypothetical protein  46.7 
 
 		 232 aa  181  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.698895  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6847  Asp/Glu/hydantoin racemase  41.67 
 
 		 219 aa  166  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3581  Asp/Glu racemase  39.81 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.278765  normal  0.265944 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0436  Asp/Glu racemase  40.47 
 
 		 219 aa  154  9e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.639222  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2342  hypothetical protein  34.6 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2968  hypothetical protein  32.06 
 
 		 225 aa  96.7  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.491451  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1505  hypothetical protein  30.59 
 
 		 231 aa  86.3  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0449573  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3408  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.65 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000155733 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2467  hypothetical protein  32.58 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430704 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1038  Asp/Glu racemase  32.8 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05661  hypothetical protein  32.64 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0128  hypothetical protein  26.96 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3133  hypothetical protein  25.13 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2913  hypothetical protein  25.13 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.719661  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3133  hypothetical protein  22.99 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0604342  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2801  Asp/Glu racemase  32.8 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.493832  normal  0.510062 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9202  hypothetical protein  33.59 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2735  hypothetical protein  23.61 
 
 		 218 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000016987  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3600  Asp/Glu racemase  30.67 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374024  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2487  Asp/Glu racemase  26.76 
 
 		 241 aa  52  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1556  Asp/Glu racemase  26.17 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.530998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  37.5 
 
 		 289 aa  41.6  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>