24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2141 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2141  Asp/Glu/hydantoin racemase  100 
 
 		 222 aa  440  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.594037  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2745  Asp/Glu/hydantoin racemase  72.73 
 
 		 220 aa  308  2.9999999999999997e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5297  hypothetical protein  49.02 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.698895  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6847  Asp/Glu/hydantoin racemase  43.58 
 
 		 219 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3581  Asp/Glu racemase  41.67 
 
 		 222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.278765  normal  0.265944 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0436  Asp/Glu racemase  46.19 
 
 		 219 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.639222  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2342  hypothetical protein  33.96 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1038  Asp/Glu racemase  36.2 
 
 		 227 aa  99  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2968  hypothetical protein  33.97 
 
 		 225 aa  92.8  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.491451  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1505  hypothetical protein  31.75 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0449573  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3408  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.57 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000155733 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2467  hypothetical protein  32.22 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430704 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0128  hypothetical protein  27.43 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2801  Asp/Glu racemase  33.64 
 
 		 218 aa  68.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.493832  normal  0.510062 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05661  hypothetical protein  32.46 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3133  hypothetical protein  23.86 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2913  hypothetical protein  23.86 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.719661  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3133  hypothetical protein  24.59 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0604342  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1556  Asp/Glu racemase  29.72 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.530998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3600  Asp/Glu racemase  31.29 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374024  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9202  hypothetical protein  28.7 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2735  hypothetical protein  23.13 
 
 		 218 aa  48.9  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000016987  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2487  Asp/Glu racemase  29.11 
 
 		 241 aa  48.9  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2428  hypothetical protein  29.53 
 
 		 260 aa  42  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>