14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2801 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2801  Asp/Glu racemase  100 
 
 		 218 aa  436  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.493832  normal  0.510062 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3600  Asp/Glu racemase  83.02 
 
 		 218 aa  321  6e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374024  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1038  Asp/Glu racemase  66.36 
 
 		 227 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3408  Asp/Glu/hydantoin racemase  44.6 
 
 		 223 aa  155  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000155733 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2517  Asp/Glu racemase  82.83 
 
 		 116 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.438751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1556  Asp/Glu racemase  36.7 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.530998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6847  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.18 
 
 		 219 aa  86.3  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2141  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.1 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.594037  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5297  hypothetical protein  28.96 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.698895  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0436  Asp/Glu racemase  28.7 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.639222  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3581  Asp/Glu racemase  26.24 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.278765  normal  0.265944 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2487  Asp/Glu racemase  35.34 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2745  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.46 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9202  hypothetical protein  29 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>