13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1556 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1556  Asp/Glu racemase  100 
 
 		 218 aa  427  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.530998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2487  Asp/Glu racemase  47.06 
 
 		 241 aa  142  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2801  Asp/Glu racemase  36.7 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.493832  normal  0.510062 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3408  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.49 
 
 		 223 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000155733 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1038  Asp/Glu racemase  34.67 
 
 		 227 aa  89.7  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3600  Asp/Glu racemase  34.84 
 
 		 218 aa  86.7  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374024  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6847  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.1 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5297  hypothetical protein  28.77 
 
 		 232 aa  65.1  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.698895  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2517  Asp/Glu racemase  44.9 
 
 		 116 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.438751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2141  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.72 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.594037  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9202  hypothetical protein  27.98 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0436  Asp/Glu racemase  26.7 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.639222  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2745  Asp/Glu/hydantoin racemase  26.17 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>