More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1730 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_1730  birA bifunctional protein  100 
 
 
262 aa  526  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0817541  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1275  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  66.53 
 
 
254 aa  317  9e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192065  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1367  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  64.92 
 
 
254 aa  289  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0904  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  62.2 
 
 
255 aa  271  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2932  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  44.44 
 
 
259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4619  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  39.41 
 
 
255 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0214611 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2418  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  38.71 
 
 
267 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.163893  hitchhiker  0.00859144 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2384  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  43.32 
 
 
264 aa  166  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1036  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  37.8 
 
 
274 aa  162  7e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.652597  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2871  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  37.55 
 
 
269 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.336309  normal  0.418687 
 
 
-
 
NC_004310  BR0816  biotin--protein ligase  35.48 
 
 
265 aa  159  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.870117  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2409  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  36.89 
 
 
265 aa  159  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3284  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  40.5 
 
 
268 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.937339  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0811  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.08 
 
 
265 aa  157  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4404  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  40 
 
 
264 aa  155  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2206  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  37.84 
 
 
270 aa  154  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1873  biotin--protein ligase  36.68 
 
 
270 aa  150  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.149167 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0792  biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  34.43 
 
 
266 aa  150  2e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0251004  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4547  putative biotin--(acetyl-CoA-carboxylase) synthetase  36.59 
 
 
269 aa  149  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.109394 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1200  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  36.26 
 
 
279 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1071  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  37.01 
 
 
279 aa  143  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal  0.636766 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1005  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  36.68 
 
 
281 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220561  normal  0.146847 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2588  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.74 
 
 
271 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.375496  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4140  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  36.73 
 
 
264 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3212  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  37.92 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187733  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2045  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  39.34 
 
 
267 aa  132  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293027  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1369  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  37.39 
 
 
249 aa  129  7.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0213578 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2818  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.98 
 
 
250 aa  125  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.499637 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3341  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  36.82 
 
 
260 aa  122  8e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2230  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  36.99 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2999  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  38.59 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2286  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  36.93 
 
 
243 aa  118  7.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1569  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  38.32 
 
 
259 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.747417  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2459  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.34 
 
 
329 aa  115  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.472126  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2532  putative biotin protein ligase  36.99 
 
 
242 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0413921  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0142  biotin--protein ligase  31.84 
 
 
319 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.330287  normal  0.0344662 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1192  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  36.99 
 
 
251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.347029 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1197  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.51 
 
 
251 aa  113  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0761  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.1 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0085  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.42 
 
 
323 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00153974  normal  0.0550519 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1295  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.59 
 
 
266 aa  108  6e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0812  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.35 
 
 
336 aa  109  6e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2876  biotin--protein ligase  33.33 
 
 
319 aa  108  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0935  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  36.44 
 
 
242 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1653  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.47 
 
 
333 aa  108  9.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1261  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.61 
 
 
326 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0077  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.39 
 
 
327 aa  108  9.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1971  biotin-(acetyl-CoA carboxylase) holoenzyme synthetase and biotin operon repressor  34.44 
 
 
327 aa  107  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2817  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.05 
 
 
336 aa  105  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000210207  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4226  biotin--protein ligase  33.1 
 
 
305 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0132  biotin--protein ligase  29.41 
 
 
320 aa  104  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000234608  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0201  biotin--protein ligase  35.51 
 
 
319 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.286867  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1420  biotin operon repressor  31.09 
 
 
326 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4706  biotin--protein ligase  29.88 
 
 
320 aa  102  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.144079  hitchhiker  0.00201782 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3757  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.74 
 
 
267 aa  102  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.450721 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3752  biotin operon repressor/biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  31.15 
 
 
326 aa  102  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1631  biotin operon repressor/biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  31.09 
 
 
326 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.104533 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1447  birA bifunctional protein  31.09 
 
 
326 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.867427  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2840  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.33 
 
 
328 aa  102  6e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1560  bifunctional biotin operon repressor/biotin--[acetyl-CoA-carboxylase] synthetase  31.09 
 
 
326 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0268  biotin--protein ligase  33.6 
 
 
320 aa  102  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0393829  hitchhiker  0.0050705 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2320  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.6 
 
 
327 aa  102  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0571544  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3775  biotin--protein ligase  30.52 
 
 
319 aa  102  7e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00231404  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0490  biotin--protein ligase  35.36 
 
 
297 aa  102  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0887139 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1463  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.09 
 
 
326 aa  102  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08620  biotin--protein ligase  36.99 
 
 
312 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000664696 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1419  biotin operon repressor  31.09 
 
 
326 aa  102  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0195  biotin--protein ligase  35.27 
 
 
319 aa  101  9e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0437  biotin--protein ligase  33.94 
 
 
319 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.193351  hitchhiker  0.00820304 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0214  biotin--protein ligase  29.72 
 
 
319 aa  101  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1704  biotin operon repressor/biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  30.67 
 
 
326 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0104372  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0467  biotin--protein ligase  34.39 
 
 
319 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.800228  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4334  biotin--protein ligase  28.22 
 
 
320 aa  101  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.152634  hitchhiker  0.00000000217796 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0327  biotin--protein ligase  31.06 
 
 
319 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0364706  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3871  biotin--protein ligase  31.06 
 
 
319 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000364778  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1987  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.02 
 
 
338 aa  101  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.417612  normal  0.841631 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1593  biotin operon repressor/biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  30.74 
 
 
326 aa  101  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4174  biotin--protein ligase  28.22 
 
 
319 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000228488  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3396  biotin--protein ligase  31.06 
 
 
319 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.199101  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2119  bifunctional BirA, biotin operon repressor/biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.55 
 
 
329 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0470  biotin--protein ligase  33.94 
 
 
319 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0969933  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3943  biotin--protein ligase  29.92 
 
 
320 aa  101  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.596693  decreased coverage  0.000472258 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4072  biotin--protein ligase  28.63 
 
 
319 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.228403 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0180  biotin--protein ligase  28.22 
 
 
319 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0210584  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0984  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.04 
 
 
335 aa  100  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.381797 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0184  biotin--protein ligase  28.22 
 
 
319 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.570128  hitchhiker  0.00065537 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3494  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.02 
 
 
263 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0197  biotin--protein ligase  32.16 
 
 
317 aa  100  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00143406  hitchhiker  0.000849017 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1666  birA bifunctional protein  30.25 
 
 
326 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0240  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.02 
 
 
247 aa  100  3e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0848  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.81 
 
 
251 aa  100  3e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.238001  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0500  bifunctional BirA, biotin operon repressor/biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.37 
 
 
329 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0654  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.69 
 
 
324 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4349  biotin--protein ligase  31.87 
 
 
320 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000983671  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4381  biotin--protein ligase  31.87 
 
 
320 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4471  biotin--protein ligase  31.87 
 
 
320 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000340796  hitchhiker  0.00000000000240151 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0391  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.17 
 
 
240 aa  99.8  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4546  biotin--protein ligase  31.87 
 
 
320 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000449604  hitchhiker  0.00000000138084 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4468  biotin--protein ligase  31.87 
 
 
320 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0221784  hitchhiker  0.00169649 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0183  biotin--protein ligase  28.16 
 
 
319 aa  99.4  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00618712  normal  0.258521 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>