More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1197 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1197  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  100 
 
 
251 aa  493  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0761  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  59.51 
 
 
249 aa  263  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1330  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  58.3 
 
 
251 aa  250  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523824  normal  0.0143061 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1192  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  56.45 
 
 
251 aa  246  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.347029 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1990  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  56.68 
 
 
251 aa  245  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2532  putative biotin protein ligase  55.56 
 
 
242 aa  237  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0413921  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2230  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  55.24 
 
 
252 aa  232  4.0000000000000004e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2871  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  40.24 
 
 
269 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.336309  normal  0.418687 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4619  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  39.11 
 
 
255 aa  129  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0214611 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3212  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  40.91 
 
 
252 aa  126  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187733  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2818  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  43.04 
 
 
250 aa  126  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.499637 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2418  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  40.66 
 
 
267 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.163893  hitchhiker  0.00859144 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2409  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  37.19 
 
 
265 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0816  biotin--protein ligase  37.04 
 
 
265 aa  122  5e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.870117  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1036  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  36.14 
 
 
274 aa  121  9e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.652597  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2206  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  37.35 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0811  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  37.04 
 
 
265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1369  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  40 
 
 
249 aa  119  6e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0213578 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4404  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  39.26 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3284  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  39 
 
 
268 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.937339  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1873  biotin--protein ligase  35.88 
 
 
270 aa  115  7.999999999999999e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.149167 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1569  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  39.81 
 
 
259 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.747417  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2932  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  38.66 
 
 
259 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2588  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  36.33 
 
 
271 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.375496  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4547  putative biotin--(acetyl-CoA-carboxylase) synthetase  36.4 
 
 
269 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.109394 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1071  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.66 
 
 
279 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal  0.636766 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2384  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.12 
 
 
264 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4226  biotin--protein ligase  32.83 
 
 
305 aa  105  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0935  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  37.67 
 
 
242 aa  105  8e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0490  biotin--protein ligase  33.21 
 
 
297 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0887139 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1200  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.33 
 
 
279 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4140  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  37.3 
 
 
264 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0792  biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  32.79 
 
 
266 aa  100  2e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0251004  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0240  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  27.83 
 
 
247 aa  100  3e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0848  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  27.78 
 
 
251 aa  100  3e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.238001  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3341  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.33 
 
 
260 aa  100  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0904  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  38.58 
 
 
255 aa  99.4  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1005  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.77 
 
 
281 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220561  normal  0.146847 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0437  biotin--protein ligase  34.98 
 
 
319 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.193351  hitchhiker  0.00820304 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0204  biotin--protein ligase  32.6 
 
 
319 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0470  biotin--protein ligase  35.05 
 
 
319 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0969933  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1730  birA bifunctional protein  35.51 
 
 
262 aa  97.8  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0817541  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0467  biotin--protein ligase  36.41 
 
 
319 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.800228  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4766  biotin--protein ligase  30.86 
 
 
321 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0199355  normal  0.789599 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2286  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.33 
 
 
243 aa  96.3  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2081  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.51 
 
 
325 aa  94  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2999  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.98 
 
 
261 aa  93.2  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4564  biotin--protein ligase  44.3 
 
 
335 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3998  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.51 
 
 
328 aa  92.8  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00153965  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0775  transcriptional repressor of the biotin operon / biotin acetyl-CoA-carboxylase synthetase; RBL03563  29.58 
 
 
325 aa  93.2  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000728901  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6032  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.27 
 
 
244 aa  92.8  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1275  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  36.4 
 
 
254 aa  92.4  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192065  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08620  biotin--protein ligase  37.11 
 
 
312 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000664696 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3926  biotin--protein ligase  35.8 
 
 
321 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541608  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1367  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  36.89 
 
 
254 aa  89  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2717  biotin--protein ligase  29.58 
 
 
320 aa  89  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000120108  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1463  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.84 
 
 
326 aa  89  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1593  biotin operon repressor/biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  31.31 
 
 
326 aa  89  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1987  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.33 
 
 
338 aa  88.6  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.417612  normal  0.841631 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0182  biotin--protein ligase  30.67 
 
 
319 aa  88.6  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000279859  normal  0.096767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0183  biotin--protein ligase  30.67 
 
 
319 aa  88.6  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00618712  normal  0.258521 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2045  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  38.15 
 
 
267 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293027  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0970  biotin protein ligase, putative  28.5 
 
 
347 aa  87  2e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.668345  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1447  birA bifunctional protein  30.84 
 
 
326 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.867427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1419  biotin operon repressor  30.84 
 
 
326 aa  87.4  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1420  biotin operon repressor  31.8 
 
 
326 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3757  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.57 
 
 
267 aa  87.4  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.450721 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1560  bifunctional biotin operon repressor/biotin--[acetyl-CoA-carboxylase] synthetase  30.84 
 
 
326 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1631  biotin operon repressor/biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  30.84 
 
 
326 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.104533 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3752  biotin operon repressor/biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  31.31 
 
 
326 aa  87  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0702  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.88 
 
 
319 aa  86.7  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0362526  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0610  birA bifunctional protein  43.54 
 
 
319 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3351  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.16 
 
 
272 aa  86.7  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.417142  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1261  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.8 
 
 
326 aa  85.9  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1666  birA bifunctional protein  30.37 
 
 
326 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0077  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.84 
 
 
327 aa  85.9  6e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0085  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.46 
 
 
323 aa  85.9  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00153974  normal  0.0550519 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0168  biotin--protein ligase  29.78 
 
 
320 aa  85.5  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00063361  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03573  putative BirA bifunctional protein  32.05 
 
 
328 aa  85.1  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.184427  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0391  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.13 
 
 
240 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0154  biotin--protein ligase  27.47 
 
 
323 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00266236  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2876  biotin--protein ligase  29.96 
 
 
319 aa  84.3  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0201  biotin--protein ligase  30.49 
 
 
319 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.286867  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0073  biotin--protein ligase  32.44 
 
 
285 aa  84  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.702906 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6247  biotin--protein ligase  32.62 
 
 
306 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.791629 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1544  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  27.39 
 
 
323 aa  83.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00491525  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1515  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  27.39 
 
 
323 aa  83.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.567415  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4334  biotin--protein ligase  26.5 
 
 
320 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.152634  hitchhiker  0.00000000217796 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2816  biotin--protein ligase  32.97 
 
 
306 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.688853  normal  0.200473 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1026  birA bifunctional protein  28.45 
 
 
323 aa  83.2  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.812765  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0142  biotin--protein ligase  28.09 
 
 
319 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.330287  normal  0.0344662 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1653  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.23 
 
 
333 aa  83.2  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2427  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.81 
 
 
321 aa  83.2  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4174  biotin--protein ligase  29.66 
 
 
319 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000228488  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0214  biotin--protein ligase  31.05 
 
 
319 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3740  biotin--protein ligase  32.89 
 
 
319 aa  82.8  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00032759  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1704  biotin operon repressor/biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  30.37 
 
 
326 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0104372  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2919  biotin--protein ligase  33.21 
 
 
306 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2290  biotin--protein ligase  33.21 
 
 
306 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2904  biotin--protein ligase  33.21 
 
 
306 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.125895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>