47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2406 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1083  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  74.16 
 
 		 742 aa  1133    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0546  photosystem I core protein PsaB  90.58 
 
 		 743 aa  1369    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0256  photosystem I core protein PsaB  86.66 
 
 		 742 aa  1310    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4143  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  88.01 
 
 		 742 aa  1325    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00848687  normal  0.293188 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4670  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  87.74 
 
 		 742 aa  1350    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.497119  normal  0.71822 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2745  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  84.77 
 
 		 746 aa  1283    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.269999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0402  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  87.58 
 
 		 742 aa  1326    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.671863 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0399  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  86.64 
 
 		 738 aa  1300    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.992775 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4104  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  88.01 
 
 		 742 aa  1325    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16401  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  74.7 
 
 		 742 aa  1154    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17151  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  75.64 
 
 		 742 aa  1164    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23471  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  72.19 
 
 		 749 aa  1136    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19581  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  74.16 
 
 		 742 aa  1133    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17021  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  75.23 
 
 		 742 aa  1160    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17271  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  75.64 
 
 		 742 aa  1164    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4668  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  85.31 
 
 		 738 aa  1318    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.298458  normal  0.0126467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2406  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  100 
 
 		 741 aa  1513    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185378  hitchhiker  0.00000443533 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2048  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  82.46 
 
 		 734 aa  1263    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.55767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2567  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  88.41 
 
 		 742 aa  1336    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0839858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1994  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  79.89 
 
 		 735 aa  1220    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.28805  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0332  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  80.11 
 
 		 737 aa  1216    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0306945  normal  0.0992407 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1615  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  75.23 
 
 		 742 aa  1163    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.687689  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0547  photosystem I core protein PsaA  43.54 
 
 		 752 aa  575  1.0000000000000001e-162  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483497  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2405  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  43.8 
 
 		 752 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.191664  hitchhiker  0.0000413722 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4669  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  43.36 
 
 		 753 aa  556  1e-157  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.33052  normal  0.086374 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2049  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  43.08 
 
 		 763 aa  551  1e-155  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.986911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0403  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  43.64 
 
 		 751 aa  551  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.709622 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4142  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  43.34 
 
 		 754 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0335436  normal  0.190714 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4671  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  42.88 
 
 		 756 aa  548  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4103  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  43.34 
 
 		 754 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1995  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  42.91 
 
 		 767 aa  540  9.999999999999999e-153  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1616  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  40.61 
 
 		 767 aa  537  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.165391  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17281  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  40.29 
 
 		 767 aa  535  1e-151  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.72658  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17161  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  40.29 
 
 		 767 aa  537  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0331  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  42.86 
 
 		 767 aa  535  1e-150  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.151933  normal  0.111224 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19571  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  40.89 
 
 		 768 aa  526  1e-148  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.300705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17031  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  41.67 
 
 		 760 aa  526  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1082  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  40.89 
 
 		 768 aa  527  1e-148  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23481  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  40.84 
 
 		 776 aa  502  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.735278 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16391  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  39.63 
 
 		 773 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.647233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2693  photosystem P840 reaction center, large subunit  33.75 
 
 		 731 aa  47  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00010493  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0219  photosystem P840 reaction center, large subunit  33.75 
 
 		 731 aa  47.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118063  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0182  photosystem P840 reaction center, large subunit  32.5 
 
 		 731 aa  46.2  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000010763  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1976  photosystem P840 reaction center, large subunit  33.75 
 
 		 734 aa  46.6  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000329009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0343  photosystem P840 reaction center, large subunit  32.5 
 
 		 731 aa  45.4  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000249067  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0305  photosystem P840 reaction center, large subunit  31.25 
 
 		 733 aa  44.7  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464493 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0274  photosystem P840 reaction center, large subunit  31.25 
 
 		 731 aa  44.3  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000580216  unclonable  0.00000320304 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>