47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0332 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1083  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  80.86 
 
 
742 aa  1234    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0546  photosystem I core protein PsaB  78.87 
 
 
743 aa  1203    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0256  photosystem I core protein PsaB  75.3 
 
 
742 aa  1141    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4143  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  85.64 
 
 
742 aa  1293    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00848687  normal  0.293188 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4670  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  81.07 
 
 
742 aa  1251    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.497119  normal  0.71822 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2745  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  76.27 
 
 
746 aa  1164    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.269999  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0402  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  82.93 
 
 
742 aa  1267    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.671863 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0399  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  82.7 
 
 
738 aa  1257    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.992775 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4104  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  85.64 
 
 
742 aa  1293    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16401  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  80.73 
 
 
742 aa  1262    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17151  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  81.54 
 
 
742 aa  1265    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23471  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  79.31 
 
 
749 aa  1246    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19581  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  80.86 
 
 
742 aa  1234    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17021  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  80.73 
 
 
742 aa  1256    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17271  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  81.54 
 
 
742 aa  1265    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4668  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  81.65 
 
 
738 aa  1258    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.298458  normal  0.0126467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2406  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  80.11 
 
 
741 aa  1218    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185378  hitchhiker  0.00000443533 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2048  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  87.03 
 
 
734 aa  1313    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.55767  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2567  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  76.38 
 
 
742 aa  1158    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0839858  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1994  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  95.66 
 
 
735 aa  1432    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.28805  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0332  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  100 
 
 
737 aa  1503    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0306945  normal  0.0992407 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1615  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  80.73 
 
 
742 aa  1264    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.687689  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2405  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  43.89 
 
 
752 aa  566  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.191664  hitchhiker  0.0000413722 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0547  photosystem I core protein PsaA  43.36 
 
 
752 aa  563  1.0000000000000001e-159  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483497  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4669  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  43.2 
 
 
753 aa  558  1e-158  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.33052  normal  0.086374 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0403  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  43.48 
 
 
751 aa  545  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.709622 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2049  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  42.39 
 
 
763 aa  542  1e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.986911  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4671  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  42.11 
 
 
756 aa  543  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4142  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  42.88 
 
 
754 aa  541  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0335436  normal  0.190714 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4103  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  42.88 
 
 
754 aa  541  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1082  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  41.61 
 
 
768 aa  525  1e-147  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17161  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  40.39 
 
 
767 aa  522  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0331  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  42.13 
 
 
767 aa  524  1e-147  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.151933  normal  0.111224 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19571  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  41.48 
 
 
768 aa  523  1e-147  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.300705  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1995  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  41.87 
 
 
767 aa  524  1e-147  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17281  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  40.26 
 
 
767 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.72658  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1616  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  40.52 
 
 
767 aa  517  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.165391  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17031  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  40.58 
 
 
760 aa  509  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16391  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  40.21 
 
 
773 aa  497  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.647233  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23481  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  39.39 
 
 
776 aa  495  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.735278 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2693  photosystem P840 reaction center, large subunit  30 
 
 
731 aa  53.1  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00010493  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1976  photosystem P840 reaction center, large subunit  30 
 
 
734 aa  52.8  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000329009  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0182  photosystem P840 reaction center, large subunit  26.34 
 
 
731 aa  53.1  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000010763  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0219  photosystem P840 reaction center, large subunit  30 
 
 
731 aa  53.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118063  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0343  photosystem P840 reaction center, large subunit  30 
 
 
731 aa  51.6  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000249067  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0274  photosystem P840 reaction center, large subunit  25.85 
 
 
731 aa  49.7  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000580216  unclonable  0.00000320304 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0305  photosystem P840 reaction center, large subunit  26.34 
 
 
733 aa  48.9  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464493 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>