31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2693 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0219  photosystem P840 reaction center, large subunit  91.66 
 
 		 731 aa  1401    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118063  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0274  photosystem P840 reaction center, large subunit  84.54 
 
 		 731 aa  1278    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000580216  unclonable  0.00000320304 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0305  photosystem P840 reaction center, large subunit  85.27 
 
 		 733 aa  1287    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464493 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0182  photosystem P840 reaction center, large subunit  89.88 
 
 		 731 aa  1372    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000010763  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2693  photosystem P840 reaction center, large subunit  100 
 
 		 731 aa  1497    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00010493  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0343  photosystem P840 reaction center, large subunit  93.3 
 
 		 731 aa  1424    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000249067  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1976  photosystem P840 reaction center, large subunit  91.28 
 
 		 734 aa  1383    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000329009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0332  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  32.38 
 
 		 737 aa  50.8  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0306945  normal  0.0992407 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19571  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  26.79 
 
 		 768 aa  50.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.300705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1082  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  26.79 
 
 		 768 aa  50.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4104  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  37.5 
 
 		 742 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4143  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  37.5 
 
 		 742 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00848687  normal  0.293188 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4668  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  36.25 
 
 		 738 aa  48.5  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.298458  normal  0.0126467 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2048  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  36.25 
 
 		 734 aa  48.5  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.55767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0402  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  36.25 
 
 		 742 aa  48.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.671863 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0399  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  36.25 
 
 		 738 aa  48.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.992775 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23481  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  27.44 
 
 		 776 aa  48.1  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.735278 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0547  photosystem I core protein PsaA  26.13 
 
 		 752 aa  48.1  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483497  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1995  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  30.81 
 
 		 767 aa  47.8  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17151  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  35 
 
 		 742 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17271  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  35 
 
 		 742 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1994  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  35 
 
 		 735 aa  47  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.28805  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2406  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  33.75 
 
 		 741 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185378  hitchhiker  0.00000443533 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17021  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  33.75 
 
 		 742 aa  46.2  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1615  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  33.75 
 
 		 742 aa  45.8  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.687689  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4670  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  35 
 
 		 742 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.497119  normal  0.71822 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16401  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  32.5 
 
 		 742 aa  45.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4103  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  27.91 
 
 		 754 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4142  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  27.91 
 
 		 754 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0335436  normal  0.190714 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4671  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  30.23 
 
 		 756 aa  44.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0403  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  26.74 
 
 		 751 aa  44.3  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.709622 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>