40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2405 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_0547  photosystem I core protein PsaA  95.48 
 
 
752 aa  1474    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483497  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4142  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  83.97 
 
 
754 aa  1282    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0335436  normal  0.190714 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4671  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  87.98 
 
 
756 aa  1317    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0403  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  84.69 
 
 
751 aa  1293    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.709622 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4103  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  83.97 
 
 
754 aa  1282    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16391  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  65.1 
 
 
773 aa  1023    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.647233  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17161  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  66.62 
 
 
767 aa  1055    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23481  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  67.82 
 
 
776 aa  1046    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.735278 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1082  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  67.91 
 
 
768 aa  1077    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19571  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  67.91 
 
 
768 aa  1076    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.300705  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17031  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  68.13 
 
 
760 aa  1053    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17281  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  66.37 
 
 
767 aa  1052    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.72658  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4669  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  83.69 
 
 
753 aa  1304    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.33052  normal  0.086374 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2049  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  81.44 
 
 
763 aa  1262    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.986911  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2405  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  100 
 
 
752 aa  1527    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.191664  hitchhiker  0.0000413722 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1616  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  66.32 
 
 
767 aa  1053    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.165391  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0331  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  74.94 
 
 
767 aa  1157    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.151933  normal  0.111224 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1995  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  76.2 
 
 
767 aa  1165    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4668  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  45.97 
 
 
738 aa  602  1e-170  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.298458  normal  0.0126467 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2048  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  45.47 
 
 
734 aa  592  1e-168  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.55767  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4670  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  44.53 
 
 
742 aa  589  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.497119  normal  0.71822 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0402  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  45.23 
 
 
742 aa  589  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.671863 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0399  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  44.94 
 
 
738 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.992775 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4143  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  45.06 
 
 
742 aa  580  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00848687  normal  0.293188 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4104  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  45.06 
 
 
742 aa  580  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0546  photosystem I core protein PsaB  44.34 
 
 
743 aa  573  1.0000000000000001e-162  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2745  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  45.53 
 
 
746 aa  568  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.269999  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1994  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  43.73 
 
 
735 aa  565  1.0000000000000001e-159  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.28805  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0332  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  43.29 
 
 
737 aa  561  1e-158  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0306945  normal  0.0992407 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2406  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  43.8 
 
 
741 aa  560  1e-158  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185378  hitchhiker  0.00000443533 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0256  photosystem I core protein PsaB  44.01 
 
 
742 aa  552  1e-156  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2567  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  44.55 
 
 
742 aa  555  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0839858  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17021  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  43.57 
 
 
742 aa  553  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1615  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  43.21 
 
 
742 aa  550  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.687689  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17151  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  43.23 
 
 
742 aa  547  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17271  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  43.23 
 
 
742 aa  547  1e-154  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19581  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  42.88 
 
 
742 aa  542  1e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16401  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  42.26 
 
 
742 aa  545  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1083  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  42.88 
 
 
742 aa  542  1e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23471  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  41.07 
 
 
749 aa  532  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>