45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1995 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_19571  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  71.06 
 
 		 768 aa  1170    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.300705  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0547  photosystem I core protein PsaA  76.98 
 
 		 752 aa  1194    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483497  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4142  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  75.91 
 
 		 754 aa  1163    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0335436  normal  0.190714 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4671  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  76.2 
 
 		 756 aa  1137    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0403  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  74.32 
 
 		 751 aa  1140    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.709622 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4103  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  75.91 
 
 		 754 aa  1163    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16391  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  68.71 
 
 		 773 aa  1123    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.647233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17161  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  72.97 
 
 		 767 aa  1188    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23481  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  72.55 
 
 		 776 aa  1169    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.735278 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1082  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  71.06 
 
 		 768 aa  1170    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17031  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  74.32 
 
 		 760 aa  1176    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17281  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  72.84 
 
 		 767 aa  1186    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.72658  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4669  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  76.43 
 
 		 753 aa  1191    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.33052  normal  0.086374 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2049  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  82.53 
 
 		 763 aa  1277    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.986911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1995  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  100 
 
 		 767 aa  1551    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1616  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  71.69 
 
 		 767 aa  1172    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.165391  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2405  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  76.2 
 
 		 752 aa  1186    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.191664  hitchhiker  0.0000413722 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0331  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  95.18 
 
 		 767 aa  1468    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.151933  normal  0.111224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4668  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  43.64 
 
 		 738 aa  577  1.0000000000000001e-163  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.298458  normal  0.0126467 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0402  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  43.06 
 
 		 742 aa  566  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.671863 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2048  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  42.97 
 
 		 734 aa  563  1.0000000000000001e-159  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.55767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0399  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  42.75 
 
 		 738 aa  561  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.992775 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4104  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  43.32 
 
 		 742 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4143  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  43.32 
 
 		 742 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00848687  normal  0.293188 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4670  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  42.67 
 
 		 742 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.497119  normal  0.71822 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0546  photosystem I core protein PsaB  42.58 
 
 		 743 aa  558  1e-157  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2745  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  43.67 
 
 		 746 aa  555  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.269999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2406  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  43.12 
 
 		 741 aa  552  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185378  hitchhiker  0.00000443533 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17021  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  42.56 
 
 		 742 aa  543  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2567  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  42.02 
 
 		 742 aa  536  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0839858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1994  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  41.91 
 
 		 735 aa  537  1e-151  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.28805  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17151  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  42.08 
 
 		 742 aa  535  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0256  photosystem I core protein PsaB  42.42 
 
 		 742 aa  537  1e-151  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17271  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  42.08 
 
 		 742 aa  535  1e-151  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0332  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  41.87 
 
 		 737 aa  535  1e-150  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0306945  normal  0.0992407 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1615  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  41.56 
 
 		 742 aa  534  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.687689  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16401  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  41.56 
 
 		 742 aa  531  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19581  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  41.56 
 
 		 742 aa  525  1e-147  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1083  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  41.56 
 
 		 742 aa  525  1e-147  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23471  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  39.64 
 
 		 749 aa  522  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1976  photosystem P840 reaction center, large subunit  30.81 
 
 		 734 aa  48.1  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000329009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2693  photosystem P840 reaction center, large subunit  30.81 
 
 		 731 aa  47.8  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00010493  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0343  photosystem P840 reaction center, large subunit  30.23 
 
 		 731 aa  47  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000249067  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0219  photosystem P840 reaction center, large subunit  29.31 
 
 		 731 aa  47.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118063  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0182  photosystem P840 reaction center, large subunit  28.49 
 
 		 731 aa  45.8  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000010763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>