40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2049 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_0547  photosystem I core protein PsaA  80.65 
 
 
752 aa  1268    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483497  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4142  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  82.27 
 
 
754 aa  1273    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0335436  normal  0.190714 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4671  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  84.66 
 
 
756 aa  1278    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0403  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  83.22 
 
 
751 aa  1295    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.709622 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4103  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  82.27 
 
 
754 aa  1273    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16391  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  68.45 
 
 
773 aa  1092    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.647233  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17161  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  71.17 
 
 
767 aa  1142    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23481  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  70.88 
 
 
776 aa  1113    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.735278 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1082  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  70.05 
 
 
768 aa  1129    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19571  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  69.79 
 
 
768 aa  1129    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.300705  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17031  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  72.76 
 
 
760 aa  1136    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17281  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  71.17 
 
 
767 aa  1142    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.72658  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4669  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  84.86 
 
 
753 aa  1328    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.33052  normal  0.086374 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2049  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  100 
 
 
763 aa  1542    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.986911  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2405  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  81.44 
 
 
752 aa  1277    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.191664  hitchhiker  0.0000413722 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1616  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  70.27 
 
 
767 aa  1135    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.165391  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0331  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  82.55 
 
 
767 aa  1279    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.151933  normal  0.111224 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1995  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  82.53 
 
 
767 aa  1270    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4668  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  44.34 
 
 
738 aa  597  1e-169  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.298458  normal  0.0126467 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2048  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  44.26 
 
 
734 aa  587  1e-166  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.55767  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4670  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  43.76 
 
 
742 aa  584  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.497119  normal  0.71822 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0402  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  44.24 
 
 
742 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.671863 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0399  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  43.56 
 
 
738 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.992775 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4143  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  43.73 
 
 
742 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00848687  normal  0.293188 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4104  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  43.73 
 
 
742 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0546  photosystem I core protein PsaB  43.02 
 
 
743 aa  566  1e-160  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2745  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  43.74 
 
 
746 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.269999  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2406  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  43.08 
 
 
741 aa  555  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185378  hitchhiker  0.00000443533 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1994  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  41.82 
 
 
735 aa  551  1e-155  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.28805  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0332  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  42.39 
 
 
737 aa  549  1e-155  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0306945  normal  0.0992407 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17021  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  43.23 
 
 
742 aa  549  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2567  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  43.28 
 
 
742 aa  548  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0839858  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0256  photosystem I core protein PsaB  43.02 
 
 
742 aa  548  1e-154  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17151  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  42.58 
 
 
742 aa  545  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1615  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  42.06 
 
 
742 aa  544  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.687689  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17271  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  42.58 
 
 
742 aa  545  1e-153  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16401  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  41.47 
 
 
742 aa  536  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19581  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  40.78 
 
 
742 aa  529  1e-149  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1083  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  40.78 
 
 
742 aa  529  1e-149  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23471  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  40.08 
 
 
749 aa  525  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>