135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0998 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0998  protein of unknown function DUF477  100 
 
 
276 aa  549  1e-155  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1186  hypothetical protein  39.31 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0460603  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0875  protein of unknown function DUF477  34.01 
 
 
264 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000594367  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0034  protein of unknown function DUF477  31.17 
 
 
286 aa  107  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1787  hypothetical protein  38.1 
 
 
238 aa  106  5e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000129243  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1830  hypothetical protein  38.73 
 
 
238 aa  104  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00424727  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0291  hypothetical protein  35.98 
 
 
265 aa  102  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1230  protein of unknown function DUF477  33.88 
 
 
294 aa  90.1  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0298184 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0897  hypothetical protein  31.16 
 
 
284 aa  88.2  1e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.803851  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1459  hypothetical protein  36.36 
 
 
254 aa  87.4  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000468004  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1228  protein of unknown function DUF477  37.42 
 
 
315 aa  86.7  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3481  hypothetical protein  37.5 
 
 
290 aa  84.7  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1299  hypothetical protein  29.47 
 
 
250 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0218065  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1419  protein of unknown function DUF477  36.42 
 
 
315 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1823  protein of unknown function DUF477  31.91 
 
 
250 aa  81.3  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0387884  normal  0.867329 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1795  protein of unknown function DUF477  28.5 
 
 
288 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.039663 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3875  hypothetical protein  31.52 
 
 
270 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.063736 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3604  protein of unknown function DUF477  32.08 
 
 
259 aa  80.1  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2422  protein of unknown function DUF477  28.14 
 
 
287 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1517  hypothetical protein  32.14 
 
 
263 aa  79.7  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.413483  normal  0.437621 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45710  hypothetical protein  30.77 
 
 
419 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3877  hypothetical protein  30.77 
 
 
422 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3392  hypothetical protein  31.41 
 
 
277 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.261896  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0659  protein of unknown function DUF477  27.42 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0394  hypothetical protein  31.69 
 
 
259 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.729327  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1773  hypothetical protein  28.5 
 
 
256 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.61154  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1903  putative glycine rich membrane protein  30.06 
 
 
285 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0812  hypothetical protein  30.63 
 
 
260 aa  78.2  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0990  hypothetical protein  31.97 
 
 
281 aa  77.4  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.698284  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0599  hypothetical protein  28.26 
 
 
396 aa  77  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1259  protein of unknown function DUF477  37.6 
 
 
315 aa  76.3  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.642039  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2277  hypothetical protein  34.81 
 
 
235 aa  76.3  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000559255  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0454  hypothetical protein  23.72 
 
 
389 aa  75.5  0.0000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47040  hypothetical protein  32.82 
 
 
237 aa  75.5  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1478  hypothetical protein  29.81 
 
 
299 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507898  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0956  hypothetical protein  31.34 
 
 
264 aa  74.7  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1821  hypothetical protein  26.03 
 
 
267 aa  75.1  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2021  hypothetical protein  33.1 
 
 
229 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000021885  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1753  hypothetical protein  26.03 
 
 
266 aa  75.1  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0410  hypothetical protein  24.37 
 
 
386 aa  74.3  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00804923 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45700  hypothetical protein  31.54 
 
 
453 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3876  glycine rich protein  32.31 
 
 
440 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2363  protein of unknown function DUF477  28.72 
 
 
246 aa  73.6  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.116241  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1082  hypothetical protein  28.04 
 
 
299 aa  73.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0606  protein of unknown function DUF477  25.98 
 
 
287 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2118  hypothetical protein  25.24 
 
 
336 aa  73.2  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0663  putative glycine rich transmembrane protein  25.24 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.928357  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1372  hypothetical protein  29.52 
 
 
290 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740234  hitchhiker  0.000166638 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0554  protein of unknown function DUF477  25.79 
 
 
287 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.475788  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2913  hypothetical protein  32.28 
 
 
297 aa  72.4  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00131763  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2026  protein of unknown function DUF477  29.88 
 
 
260 aa  72  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.903181 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3955  hypothetical protein  23.61 
 
 
302 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3227  hypothetical protein  29.84 
 
 
277 aa  71.6  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0414  protein of unknown function DUF477  34.85 
 
 
246 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06980  hypothetical protein  30.77 
 
 
341 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04652  glycine rich protein  30.94 
 
 
288 aa  70.1  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00734388  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1392  hypothetical protein  31.25 
 
 
166 aa  69.7  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5849  protein of unknown function DUF477  28.57 
 
 
282 aa  69.3  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.522543 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4545  hypothetical protein  28.75 
 
 
286 aa  69.3  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127077  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0285  putative lipoprotein  26.71 
 
 
284 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562494  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6373  hypothetical protein  30.5 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0774641  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0639  hypothetical protein  29.08 
 
 
343 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2047  hypothetical protein  26.92 
 
 
283 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.976247  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3371  putative lipoprotein  27.74 
 
 
282 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0509  putative lipoprotein  26.35 
 
 
282 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2296  protein of unknown function DUF477  30.5 
 
 
261 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00760531 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3041  putative lipoprotein  27.74 
 
 
282 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2051  putative lipoprotein  27.74 
 
 
282 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0314  putative lipoprotein  27.54 
 
 
282 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2233  putative lipoprotein  27.74 
 
 
282 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2160  hypothetical protein  27.63 
 
 
284 aa  67  0.0000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2019  hypothetical protein  30.5 
 
 
261 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2527  hypothetical protein  28.21 
 
 
256 aa  66.6  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00024916  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3401  hypothetical protein  25.12 
 
 
288 aa  66.6  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2033  hypothetical protein  27.46 
 
 
285 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1670  hypothetical protein  37.5 
 
 
269 aa  66.6  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.946532  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0327  putative lipoprotein  27.74 
 
 
282 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5308  protein of unknown function DUF477  26.49 
 
 
293 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.16736  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1821  protein of unknown function DUF477  28.12 
 
 
271 aa  66.2  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.367248  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1401  protein of unknown function DUF477  32.46 
 
 
264 aa  66.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1696  protein of unknown function DUF477  26.49 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.973781  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2915  hypothetical protein  26.35 
 
 
294 aa  65.9  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0386021  normal  0.901055 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4747  hypothetical protein  30.12 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0582717 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0011  hypothetical protein  27.65 
 
 
266 aa  65.9  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.496053  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1981  protein of unknown function DUF477  29.79 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1334  hypothetical protein  26.25 
 
 
290 aa  65.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6688  hypothetical protein  27.74 
 
 
295 aa  65.5  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0102145  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1255  protein of unknown function DUF477  26.5 
 
 
302 aa  65.1  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0178341  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4038  hypothetical protein  27.78 
 
 
301 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000052611  normal  0.949055 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3082  hypothetical protein  27.33 
 
 
290 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000317552  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0361  hypothetical protein  28.02 
 
 
435 aa  63.9  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.343727 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6199  hypothetical protein  27.45 
 
 
283 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1222  protein of unknown function DUF477  31.75 
 
 
253 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4289  hypothetical protein  25.43 
 
 
205 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0664  hypothetical protein  27.86 
 
 
274 aa  63.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1889  hypothetical protein  32.67 
 
 
272 aa  63.5  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3713  hypothetical protein  25.81 
 
 
301 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.915027  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3992  hypothetical protein  25.73 
 
 
237 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.222479 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0878  hypothetical protein  28.12 
 
 
279 aa  62.8  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0236831  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3313  protein of unknown function DUF477  27.27 
 
 
564 aa  62.8  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.154866  hitchhiker  0.000293025 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>