131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3313 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3313  protein of unknown function DUF477  100 
 
 		 564 aa  1183    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.154866  hitchhiker  0.000293025 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1259  protein of unknown function DUF477  32.64 
 
 		 315 aa  100  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.642039  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1419  protein of unknown function DUF477  32.52 
 
 		 315 aa  99.4  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2913  hypothetical protein  32.52 
 
 		 297 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00131763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3877  hypothetical protein  30.16 
 
 		 422 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1228  protein of unknown function DUF477  33.11 
 
 		 315 aa  94  6e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0361  hypothetical protein  36.88 
 
 		 435 aa  92.8  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.343727 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45710  hypothetical protein  30.2 
 
 		 419 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2033  hypothetical protein  32.21 
 
 		 285 aa  92.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1186  hypothetical protein  33.75 
 
 		 258 aa  90.9  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0460603  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2277  hypothetical protein  30.43 
 
 		 235 aa  87.8  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000559255  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1288  hypothetical protein  28.47 
 
 		 423 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2160  hypothetical protein  31.06 
 
 		 284 aa  86.7  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0410  hypothetical protein  35.26 
 
 		 386 aa  85.5  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00804923 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1795  protein of unknown function DUF477  27.59 
 
 		 288 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.039663 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1670  hypothetical protein  35.71 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.946532  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1372  hypothetical protein  31.85 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740234  hitchhiker  0.000166638 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3604  protein of unknown function DUF477  31.71 
 
 		 259 aa  84  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0454  hypothetical protein  35.33 
 
 		 389 aa  83.6  0.000000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0414  protein of unknown function DUF477  31.71 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0897  hypothetical protein  23.88 
 
 		 284 aa  83.2  0.00000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.803851  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0875  protein of unknown function DUF477  30.73 
 
 		 264 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000594367  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1401  protein of unknown function DUF477  39.36 
 
 		 264 aa  82  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0034  protein of unknown function DUF477  30.32 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2422  protein of unknown function DUF477  27.78 
 
 		 287 aa  82  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4038  hypothetical protein  33.33 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000052611  normal  0.949055 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1459  hypothetical protein  32.84 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000468004  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0639  hypothetical protein  28.92 
 
 		 343 aa  80.5  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1478  hypothetical protein  29.63 
 
 		 299 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507898  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5849  protein of unknown function DUF477  32.89 
 
 		 282 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.522543 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0416  hypothetical protein  31.36 
 
 		 287 aa  79  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1230  protein of unknown function DUF477  29.92 
 
 		 294 aa  79.3  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0298184 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3227  hypothetical protein  30.66 
 
 		 277 aa  78.6  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45700  hypothetical protein  26.03 
 
 		 453 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1821  protein of unknown function DUF477  32.2 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.367248  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4334  protein of unknown function DUF477  28.34 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.82734 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06980  hypothetical protein  26.11 
 
 		 341 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47040  hypothetical protein  31.62 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3481  hypothetical protein  27.4 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2296  protein of unknown function DUF477  27.89 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00760531 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1510  hypothetical protein  33.07 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.402719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2019  hypothetical protein  27.89 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1255  protein of unknown function DUF477  26.62 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0178341  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1830  hypothetical protein  29.56 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00424727  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1189  hypothetical protein  29.13 
 
 		 281 aa  76.3  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0394  hypothetical protein  26.53 
 
 		 259 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.729327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0291  hypothetical protein  28.76 
 
 		 265 aa  76.3  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2363  protein of unknown function DUF477  26.77 
 
 		 246 aa  75.5  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.116241  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3702  hypothetical protein  30.53 
 
 		 266 aa  75.5  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83448  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2021  hypothetical protein  26.5 
 
 		 229 aa  76.3  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000021885  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1762  protein of unknown function DUF477  28.17 
 
 		 307 aa  75.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.485399  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0599  hypothetical protein  30.67 
 
 		 396 aa  75.9  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1082  hypothetical protein  27.27 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2026  protein of unknown function DUF477  25.17 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.903181 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1787  hypothetical protein  30.22 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000129243  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6373  hypothetical protein  29.55 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0774641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3713  hypothetical protein  28.12 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.915027  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0878  hypothetical protein  30.66 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0236831  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4747  hypothetical protein  30.16 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0582717 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2915  hypothetical protein  26.52 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0386021  normal  0.901055 
 
 
-
 
NC_004310  BR1821  hypothetical protein  24.14 
 
 		 267 aa  73.2  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0659  protein of unknown function DUF477  27.82 
 
 		 295 aa  73.2  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2693  hypothetical protein  28.91 
 
 		 301 aa  73.6  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1753  hypothetical protein  24.14 
 
 		 266 aa  73.2  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1981  protein of unknown function DUF477  27.21 
 
 		 262 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1720  hypothetical protein  27.21 
 
 		 320 aa  72.8  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1299  hypothetical protein  30.14 
 
 		 250 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0218065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3955  hypothetical protein  26.71 
 
 		 302 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1903  putative glycine rich membrane protein  23.91 
 
 		 285 aa  72  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3401  hypothetical protein  26.21 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0011  hypothetical protein  28.57 
 
 		 266 aa  72  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.496053  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3371  putative lipoprotein  25.79 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6199  hypothetical protein  24.26 
 
 		 283 aa  71.6  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0509  putative lipoprotein  25.79 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3041  putative lipoprotein  25.79 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2051  putative lipoprotein  25.79 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2233  putative lipoprotein  25.79 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1823  protein of unknown function DUF477  26.43 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0387884  normal  0.867329 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0327  putative lipoprotein  25.62 
 
 		 282 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0424  hypothetical protein  28.35 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1222  protein of unknown function DUF477  28.26 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3875  hypothetical protein  28.26 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.063736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6688  hypothetical protein  26.04 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0102145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2118  hypothetical protein  24.56 
 
 		 336 aa  69.7  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0314  putative lipoprotein  25.16 
 
 		 282 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3876  glycine rich protein  28.57 
 
 		 440 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1334  hypothetical protein  28.36 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0812  hypothetical protein  27.21 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0258  hypothetical protein  26.63 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.734577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1392  hypothetical protein  25 
 
 		 166 aa  68.2  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04652  glycine rich protein  30.39 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00734388  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3392  hypothetical protein  24.09 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.261896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1773  hypothetical protein  23.7 
 
 		 256 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.61154  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0285  putative lipoprotein  24.39 
 
 		 284 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562494  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2520  protein of unknown function DUF477  25.53 
 
 		 298 aa  66.6  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2627  hypothetical protein  27.21 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0330  hypothetical protein  27.27 
 
 		 309 aa  65.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.570024 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4545  hypothetical protein  29.29 
 
 		 286 aa  65.9  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127077  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04780  hypothetical protein  26.97 
 
 		 267 aa  65.5  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.746137  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3453  hypothetical protein  32.61 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.529474  normal  0.0920314 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>