More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0644 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0644  histidine kinase  100 
 
 		 430 aa  850    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00287376  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3868  histidine kinase  25.79 
 
 		 454 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0154  sensor histidine kinase/response regulator  28.79 
 
 		 445 aa  126  7e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.313173 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1940  histidine kinase  24.82 
 
 		 478 aa  112  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.208818  normal  0.0947013 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05750  signal transduction histidine kinase  22.75 
 
 		 420 aa  107  6e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.101314  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0907  sensor histidine kinase  27.75 
 
 		 464 aa  100  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0924  sensor histidine kinase; MrsK2 protein  27.54 
 
 		 464 aa  98.6  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.115841  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1987  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.16 
 
 		 468 aa  95.5  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.905736  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1803  sensor histidine kinase  24.61 
 
 		 450 aa  94  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43373  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15590  periplasmic sensory histidine protein kinase  22.3 
 
 		 446 aa  91.3  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506473  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.27 
 
 		 446 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0126885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3591  sensor histidine kinase  23.81 
 
 		 449 aa  87  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148051  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22730  putative two-component sensor  25.77 
 
 		 445 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172157  normal  0.0503129 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2424  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.24 
 
 		 493 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.444371 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.96 
 
 		 446 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000501512  normal  0.872654 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4011  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.75 
 
 		 446 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.704889  hitchhiker  0.0000182562 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1920  putative two-component sensor  25.95 
 
 		 445 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.91 
 
 		 430 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.09 
 
 		 488 aa  84  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.996229 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.09 
 
 		 488 aa  84  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2541  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 		 503 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3794  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.96 
 
 		 446 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000335712 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3433  sensor protein CpxA  23.41 
 
 		 453 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0911326  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2327  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.91 
 
 		 591 aa  78.6  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693405 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000179203 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1866  putative two-component system sensor kinase  23.26 
 
 		 468 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5350  histidine kinase  28.77 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485302  normal  0.0898754 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.75 
 
 		 427 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000439067  normal  0.678719 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3430  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.642947  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.94 
 
 		 462 aa  77.8  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289795  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0737  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 		 408 aa  77.8  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000118464  decreased coverage  0.00150782 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 389 aa  77  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0033  histidine kinase  21.68 
 
 		 446 aa  77  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.77 
 
 		 453 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0167  osmolarity sensor protein  26.28 
 
 		 436 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.642764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2624  histidine kinase  22.19 
 
 		 466 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000627853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0870  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.12 
 
 		 469 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1333  histidine kinase  23.69 
 
 		 461 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249082  normal  0.153676 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1481  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  21.19 
 
 		 446 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0335199  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2617  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.3 
 
 		 448 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00536  putative sensor histidine kinase protein  22.45 
 
 		 453 aa  75.5  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2646  histidine kinase  22.3 
 
 		 448 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.3 
 
 		 448 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2031  sensor histidine kinase  21.48 
 
 		 344 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1979  sensor histidine kinase  23.1 
 
 		 433 aa  74.3  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.690956 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  21.98 
 
 		 448 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.304417 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23 
 
 		 422 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000233737  normal  0.0772482 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2755  sensor protein qseC  22.84 
 
 		 454 aa  73.9  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276799  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1716  sensor histidine kinase  27.24 
 
 		 375 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0201227  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1351  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.38 
 
 		 461 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  25.64 
 
 		 467 aa  73.9  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1409  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 		 489 aa  73.6  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3919  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.74 
 
 		 448 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.18 
 
 		 463 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2146  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.68 
 
 		 476 aa  73.6  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.79 
 
 		 420 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000317238  normal  0.345558 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4142  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.32 
 
 		 463 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129438  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1957  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  20.62 
 
 		 431 aa  73.2  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.22803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2323  histidine kinase  25.81 
 
 		 497 aa  72.4  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1957  sensor histidine kinase, putative  25.5 
 
 		 355 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.409258  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1840  sensor protein RstB  19.87 
 
 		 432 aa  72.8  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0557058 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2216  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.45 
 
 		 447 aa  73.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1690  sensor histidine kinase  25.84 
 
 		 375 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  23.79 
 
 		 458 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2318  sensor histidine kinase  19.88 
 
 		 423 aa  72.8  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4830  two-component regulatory system sensory histidine kinase  23.93 
 
 		 457 aa  72.4  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00276208  normal  0.0320947 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01578  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with RstA  22.4 
 
 		 433 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0585044  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  24.34 
 
 		 458 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3595  sensor protein RstB, putative  23.57 
 
 		 440 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1894  histidine kinase  22.99 
 
 		 471 aa  71.6  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0479288 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3391  histidine kinase  28.33 
 
 		 485 aa  72  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0812164  normal  0.286483 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1580  sensor histidine kinase  26.16 
 
 		 462 aa  72.4  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0943053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1684  sensor protein RstB  22.4 
 
 		 433 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457824  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2021  sensor protein RstB  22.4 
 
 		 433 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3282  histidine kinase  24.13 
 
 		 483 aa  72  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.04 
 
 		 429 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  23.57 
 
 		 458 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3185  ATPase domain-containing protein  22.9 
 
 		 422 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00240847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01568  hypothetical protein  22.4 
 
 		 433 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0704541  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.03 
 
 		 455 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239183 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.97 
 
 		 425 aa  71.2  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3675  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  20.59 
 
 		 379 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.203937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0753  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.53 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0120668 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3103  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 		 522 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6516  histidine kinase  23.4 
 
 		 429 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0252048 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1590  sensor protein RstB  21.17 
 
 		 433 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00520331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  21.18 
 
 		 467 aa  71.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0676  histidine kinase  23.15 
 
 		 400 aa  70.9  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.887775  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  24.78 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  24.34 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  25.17 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1795  sensor protein RstB  22.33 
 
 		 433 aa  70.9  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0023579  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0258  histidine kinase  22.19 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  22.73 
 
 		 1162 aa  71.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1235  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.95 
 
 		 456 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.403806  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2034  histidine kinase  21.17 
 
 		 433 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0105815  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  22.39 
 
 		 456 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1022  histidine kinase  22.61 
 
 		 580 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1829  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.75 
 
 		 443 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.957037 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2843  Osmosensitive K channel His kinase sensor  26.91 
 
 		 926 aa  70.5  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>