More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0154 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0154  sensor histidine kinase/response regulator  100 
 
 		 445 aa  910    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.313173 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3868  histidine kinase  34.72 
 
 		 454 aa  268  1e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1940  histidine kinase  32 
 
 		 478 aa  222  9.999999999999999e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.208818  normal  0.0947013 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05750  signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 		 420 aa  184  3e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.101314  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0907  sensor histidine kinase  27.39 
 
 		 464 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0924  sensor histidine kinase; MrsK2 protein  27.17 
 
 		 464 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.115841  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1987  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.85 
 
 		 468 aa  146  7.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.905736  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0644  histidine kinase  27.59 
 
 		 430 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00287376  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.73 
 
 		 470 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  27.92 
 
 		 468 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0843  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 585 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  26.03 
 
 		 467 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1402  sensor histidine kinase  25.37 
 
 		 478 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00361795  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4169  sensor histidine kinase  26.61 
 
 		 580 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.6 
 
 		 641 aa  109  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1172  sensor histidine kinase  26.3 
 
 		 580 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0874083  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  28.68 
 
 		 477 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3517  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.73 
 
 		 407 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  28.8 
 
 		 458 aa  108  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  28.98 
 
 		 458 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04720  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 331 aa  106  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0135462  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  28.34 
 
 		 458 aa  107  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  28.12 
 
 		 458 aa  106  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  28.12 
 
 		 458 aa  106  9e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1022  histidine kinase  25.55 
 
 		 580 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1217  sensor histidine kinase  25.69 
 
 		 580 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  27.8 
 
 		 458 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 		 425 aa  105  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  27.8 
 
 		 458 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  27.8 
 
 		 458 aa  104  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.51 
 
 		 597 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  27.97 
 
 		 458 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  27.97 
 
 		 458 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  25.64 
 
 		 473 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1957  sensor histidine kinase, putative  26.57 
 
 		 355 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.409258  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0455  phosphate regulon sensor protein  28.24 
 
 		 431 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0436  phosphate regulon sensor protein  28.24 
 
 		 431 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1274  sensor histidine kinase  25.08 
 
 		 580 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0442  phosphate regulon sensor protein  28.24 
 
 		 431 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0497  phosphate regulon sensor protein  28.24 
 
 		 431 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0436  phosphate regulon sensor protein  28.24 
 
 		 431 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1017  sensor histidine kinase  24.77 
 
 		 580 aa  100  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479121  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2092  histidine kinase  25.64 
 
 		 555 aa  99.8  8e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00961022  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1716  sensor histidine kinase  25.58 
 
 		 375 aa  99.8  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0201227  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0250  histidine kinase  23.88 
 
 		 501 aa  99.8  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.162679  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1016  sensor histidine kinase  24.77 
 
 		 580 aa  99.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.853387  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  23.72 
 
 		 496 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1197  sensor histidine kinase  24.77 
 
 		 580 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.970095 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1039  sensor histidine kinase  24.92 
 
 		 580 aa  99  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1690  sensor histidine kinase  25.25 
 
 		 375 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1118  sensor histidine kinase  24.92 
 
 		 580 aa  99  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3839  two-component sensor PhoR  28.77 
 
 		 434 aa  99  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000175105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0783  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.18 
 
 		 479 aa  98.6  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3472  sensor protein VanS  25.16 
 
 		 337 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.290028  hitchhiker  0.000000136839 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3137  histidine kinase  26.13 
 
 		 455 aa  98.2  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0840  histidine kinase  25.53 
 
 		 363 aa  97.8  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133727 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.1 
 
 		 597 aa  97.4  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.72 
 
 		 437 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  25.9 
 
 		 310 aa  97.1  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  25 
 
 		 1400 aa  96.7  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4604  sensor histidine kinase  25.58 
 
 		 368 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.1143  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4990  sensor histidine kinase  24.52 
 
 		 368 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3209  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 431 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1749  sensor protein CpxA  27.33 
 
 		 472 aa  96.3  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0671148  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0319  phosphate regulon sensor protein  27.72 
 
 		 431 aa  95.9  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397262  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  24.17 
 
 		 461 aa  96.3  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0203  osmolarity sensor protein  24.84 
 
 		 435 aa  95.9  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00348  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with PhoB  27.72 
 
 		 431 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5009  sensor histidine kinase  25.58 
 
 		 368 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 		 1029 aa  95.1  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135444  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4744  sensor histidine kinase  24.2 
 
 		 368 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4582  sensor histidine kinase  24.2 
 
 		 368 aa  95.5  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.24147  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00352  hypothetical protein  27.72 
 
 		 431 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1042  histidine kinase  25.63 
 
 		 438 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0389643  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5105  sensor histidine kinase  24.2 
 
 		 368 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3233  phosphate regulon sensor protein  27.72 
 
 		 431 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62554  unclonable  0.0000000115446 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0430  phosphate regulon sensor protein  27.72 
 
 		 431 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.35 
 
 		 468 aa  95.5  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0428  phosphate regulon sensor protein  27.72 
 
 		 431 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0468  phosphate regulon sensor protein  27.72 
 
 		 431 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0941  histidine kinase  28.23 
 
 		 540 aa  95.5  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.036916  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00622  osmolarity sensor protein  26.37 
 
 		 430 aa  94.7  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.72 
 
 		 584 aa  94.7  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  25.19 
 
 		 352 aa  94.4  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1870  sensor protein VanS  26.33 
 
 		 291 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0476  phosphate regulon sensor protein  27.34 
 
 		 431 aa  94  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1986  sensor protein VanS  25.98 
 
 		 291 aa  94  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.871173  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.29 
 
 		 584 aa  94  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3196  histidine kinase  30.13 
 
 		 356 aa  94  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0721667  normal  0.0151706 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.6 
 
 		 487 aa  94  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.81 
 
 		 473 aa  93.6  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0775  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 449 aa  94  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.82168  normal  0.228948 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.72 
 
 		 446 aa  93.6  6e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1913  sensory box histidine kinase  26.49 
 
 		 288 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0149315 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  22.17 
 
 		 461 aa  93.6  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1790  sensor histidine kinase  25.2 
 
 		 453 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000385463  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2179  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.5 
 
 		 450 aa  93.6  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0821268 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1866  putative two-component system sensor kinase  27.17 
 
 		 468 aa  93.6  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0868  phosphate regulon sensor protein  29.41 
 
 		 431 aa  93.6  7e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.655854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22040  signal transduction histidine kinase  22.97 
 
 		 428 aa  93.2  8e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>